鱼锚头鱼蚤以头部和一部分胸部钻入宿主的肌肉组织或鳞片下，使伤口红肿发炎，鳞片腐烂，同时因吸食鱼的血液和体液，使鱼生长迟缓，也可使幼鱼死亡。锚头鱼蚤的寄生也可引起大鱼的死亡。其防治措施有以下几点：
1.全池遍洒90%晶体敌百虫，使池水成0.3~0.7g/立方米浓度，杀死池中锚头鱼蚤的幼虫，根据锚头鱼蚤的寿命及繁殖特点，须连续下药2~3次，每次间隔的天数随水温而定，一般为7天，水温高隔天数少；反之，则多。
2.高锰酸钾水溶液药浴，根据草鱼和鲢、鳙鱼对高锰酸钾的耐药性不同，进行药浴处理，可杀死锚头鱼蚤的幼虫和成虫，但在生产上应用较麻烦。
3.免疫的应用。利用锚头鱼蚤对寄主的选择性，可采用轮养法，以达到预防的目的；采用人工方法使鱼种获得免疫力后，再放入大水面饲养，以控制大面积水体中锚头鱼蚤病的发生。
