1、药物清除：应用常规的生石灰、漂白粉或者新药强氯精结合清塘工作进行，可以清洁水质，杀灭野杂鱼、螺、水生昆虫及细菌和寄生虫等病原体；对放养苗种更为有益。
2、水源过滤：水源过滤能有效地控制野杂鱼，特别是鱼苗、鱼种塘，经过清塘后的野杂鱼往往是由水源进入，抢食家鱼饵料，有些肉食或杂食鱼品种甚至残食家鱼苗。所以，进水水源最好经过过滤，过滤袋以2 毫米聚乙烯、纱材料制做较宜，可拦控杂鱼、卵、水生昆虫等。从而减少其对家鱼的侵害。
3、捕捞清除：⑴喂食笼捕捞清除：采用喂食笼，以牛、鸡杂骨、或者菜籽饼、鲜虾仁等作饵料诱捕，效果较好。⑵丝网捕捞清除：如果上层杂鱼较多，可利用它们喜游表层水摄食的习性，把饵料集中投在饵料台周围。投饵后1小时主养鱼吃食离去后，在食台周围下丝网捕捞，可清除一些上层杂鱼。⑶利用锻炼鱼种或者出售鱼种操作清除：利用杂鱼比家鱼更不耐低氧环境的生物学特性，在鱼种吊箱锻炼后，若过筛仍难清除，可适量密集在一斗，杂鱼不耐低氧浮出水面捞除。用此法要掌握家鱼的忍耐程度，防止缺氧损伤鱼种。
