药物配合使用可充分发挥各种药物的协同作用，有利于提高病害防治效果，其疗效通常优于单一药物治疗。但需要注意的是，联合使用某些药物会危害畜禽健康，进而影响养殖效益。例如，链霉素与卡那霉素、庆大霉素配合使用会加大对畜禽听觉神经的损害。
使用痢特灵治疗鸡肠道感染时，应按规定剂量投药，还应研细后搅拌均匀，以防因采食过量发生药害。敌百虫的灭虫效果良好，但使用不当会对环境和畜禽造成严重危害。以家禽为例，如使用敌百虫进行治疗可导致其中毒致死。而左旋咪唑广谱高效且低毒，在为禽类驱除寄生虫时可选用该药物，尽量避免使用敌百虫。盐霉素是抗球虫的理想药物，但仅适用于禽、猪、牛、兔等，不应用于对马属动物的治疗。四环素类药物属广谱抗生素，对多种病原菌具有抑制作用，但会刺激畜禽机体，易引发二重感染，造成肝脏损害和维生素缺乏，不能通过肌肉注射给药（土霉素除外）；甲硫酸新斯的明可促进胃肠道平滑肌运动，在肠道阻塞配合治疗中可发挥重要作用，但在某些情况下（完全阻塞或肠道蠕动音消失）应避免使用，以防肠管破裂；10%稀盐酸可用于因胃酸缺乏所引发的消化不良、食欲不振、胃内发酵等疾病的治疗，但临床使用其治疗不同畜禽时应控制好剂量，使用净水50倍稀释，如用量过大会对胃排空造成影响，引发腹痛。
避免药物残留
某些抗菌药物受代谢缓慢等因素的影响，在用药后可能会对人体造成危害，因此对上述药物均有相应的休药期规定。例如土霉素和三甲氧苄氨嘧啶的休药期均为5天，但庆大霉素长达35天。盐酸左旋咪唑经猪一次口服后其休药期为30天，但采用肌肉或皮下注射给药时其休药期要延长至28天。另外，不同畜禽用同一药物的休药期也可能存在差异。例如，猪经皮下注射伊维菌素注射液后休药期为28天，但牛为35天，羊则长达42天。因此，在临床用药时应注意产品的上市日期并区分不同动物，避免因药物残留超标带来安全隐患。
确保药品质量，防用假冒伪劣药品
临床应用兽药时应确保药品质量，使用合格药品，避免使用假药、劣质药、变质药、过期药和淘汰药等。由于药品超过有效期后，其效价迅速下降或失效，使用后有害无益，因此在使用药物前应辨别其有效期规定，避免使用过期药品。不使用发生潮解或变质的药品，也不能使用无照兽药厂生产的药品。已经淘汰的药物通常都有严重的毒副作用。为确保用药安全，应避免购买和使用。
