柱状黄杆菌引起的烂鳃病，根据水温的不同，呈现出发病快慢也不一样。4月份左右，水温刚开始升至15℃以上时，往往呈现出慢性发病，先是鳃丝感染，从鳃丝的末端开始发生炎性水肿，继而发生细胞增生，最后才是鳃丝坏死，露出软骨。初期发病时，由于鳃丝炎性水肿，所以降低了水体中的溶氧通过鳃小片进入鱼体，让鱼容易出现假性缺氧。这是初春经常碰到的，时常有的鱼在水面浮头好多天，泼上消炎的药和维生素，鱼很快就不浮头了。
除了慢性烂鳃外，与之相对应的还有一种急性烂鳃，就是环境差、氨氮高、底质酸化，由于氮分子腐蚀了鳃小片，被感染了柱状黄杆菌的鳃丝，迅速由炎性水肿转变成环死。像近期草鱼烂鳃病，就易发于有机质多、淤泥厚、氨氮高的养殖水体。如果pH值偏低，施用生石灰，如果不好购买生石灰，可用黑碳晶和底改片替代，先改底，再沉淀，再结合内服狄诺康和维生素C，可大大的提高治疗效果，缩短治疗时间。
