一、品种选择
稻田中杂草和底栖动物数量多，而浮游生物少，因此稻田养鱼以放养草鱼、鲤鱼、鲫鱼、非鲫、革胡子鲇等吃食性鱼类为主，少量搭配鲢鳙鱼。饲养食用鱼时，可按草鱼40-50％，鲤鲫20-30％，鲢鳙20-30％搭配，或按鲤60-80％，草鱼、非鲫和鲢、鳙鱼20-40％配养。在稻萍鱼综合养殖系统中，以主养非鲫效果最好。鱼种最好单养，若需混养，品种3-5个为宜，以免鱼种类过多，而幼鱼阶段食性相近，竞争性强。成鱼阶段不同种类的鱼食性差异大，多个品种混养可充分利用饵料资源。
二、鱼种规格和放养密度
(一)放养规格
放养规格与养殖目的有关：若为培养鱼种，则放养夏花鱼苗，如利用秧田、早稻田培养草鱼或鲤鱼种，也可将附着鲤鱼卵的鱼巢直接放入秧阻孵化；若为培养大规格鱼种，可放养3.3-5厘米以上的鱼种；如培养食用鱼，应放养全长16-25厘米的大规格鱼种，如四川省南充市顺庆区稻田养成鱼，要求放养的鲤鱼尾重50-150克、草鱼尾重150-250克。
(二)放养密度
放养密度与鱼种规格、沟溜坑凼的面积和水稻种植方式有关，沟溜坑凼面积大时，密度可大一些，鱼种规格大时应少放一些。
三、放养时间及放养前处理
(一)放养时间
稻田养鱼放鱼的时间取决于放养规格和种类。当培养鱼种时，在秧田撒稻种早稻田插秧开好鱼沟装好鱼栅后放鱼；而放养7厘米左右吃食性夏花鱼种时，需在秧苗返青后放养，以免鱼吞食秧苗；隔年草鱼种必须在水稻圆秆及有效分蘖结束后才放入田中觅食。目前许多地方稻田养鱼为延长鱼的生长期，早在插秧前已将鱼苗或鱼种投放到鱼溜鱼凼中了，待秧苗返青后加深水位，打通鱼沟鱼道，放鱼入田。
稻田养鱼多种鱼混养时，各种鱼是同时投放还是分批放养受天然饵料的数量限制，一般是一次投足，也有轮捕轮放的作法。如单季稻田周年养鱼时，水稻收割淹青后浮游生物才大量繁殖，此时必须增投鲢鳙鱼种，以充分利用饵料资源。
(二)放养前处理
放鱼前10-15天，鱼凼、沟溜用生石灰消毒，其方法同池塘清塘。鱼苗鱼种放养前用2-4％的食盐水浸泡3-5分钟，也可用8ppm硫酸铜，或10ppm漂白粉，或20ppm高锰酸钾浸泡鱼体。鱼种大、水温低时，浸泡时间长，反之则短，通过浸泡可预防多种鱼病。
