使用生石灰清塘，具有药效广谱、成本低廉、调节水质、改良底质、保障鱼体钙的吸收促进鱼类生长、预防鱼类软骨病、畸形病的发生，以及绿色环保等诸多优点。但用量盲目、方法失当，往往事倍功半，甚至南辕北辙。
不同的池塘池底淤泥的厚度不同，淤泥的成分也存在差异。再者，池塘自身也有的是碱性有的呈酸性，因此，使用生石灰清塘，并非“多多益善”。生石灰的使用量要因池而宜。使用生石灰后，使池水pH值超过10以上并2小时不下降，即可取得杀灭鱼类病原体和敌害生物的效果。过量使用生石灰，首先不仅增加养殖成本，纯粹是一种浪费，而且还会使水体中部分营养成分流失，例如，将水体中的磷变成不溶性磷灰石，使得水体缺磷，从而抑制浮游植物乃至浮游动物的生长和繁殖，导致鱼虾产量降低。其次，盲目加大生石灰的用量还可大幅提高水体中氨氮的毒性。当水温在15℃、pH值6-8之间时，pH值每提高1，氨氮的毒性就会提高10倍。毒性较大延误鱼虾生长，毒性强烈则危及鱼虾生命。另外，鱼类适宜在微碱性的水体中生长，其pH值为7.5-8.5。如果pH值低于6.0或高于9.0，就会对鱼类造成不良影响。因此，生石灰使用量过大造成水体pH值过高，完全不利于鱼类生长。
干塘清塘每亩用量一般为100公斤-150公斤；带水清塘每亩平均水深1米，用120公斤-150公斤。水温较低时因药效较差要酌情加量，如早春水温3℃-5℃时要适当增加用量20%-30%。“陈池老塘”要多使，新挖池塘要少使；呈酸性土质池塘可多使，呈减性土质池塘则少使；施用有机肥池塘可多使，施用无机肥池塘要少使。
实践证明，带水清塘不仅省工且效果优于干塘清塘，具体方法：将生石灰装入箩筐，悬于船体两侧，沉入水中，人工摇晃箩筐，使生石灰有效部分充分融化于水中。干塘清塘，一定要“趁热打铁”，在生石灰吸水熔化、不等冷却即向四周泼洒。无论是干塘清塘还是带水清塘，力求均匀，否则，药效难及预期。清塘时间应选择晴天中午到下午4点以前进行，阴雨天气温低会影响效果，不宜进行。
生石灰不能与漂白粉、硫酸铜、敌百虫同时使用，因为生石灰遇漂白粉、硫酸铜会起中和反应而失效或减弱药效；生石灰遇敌百虫会使毒性增高数倍。
