在河蟹捕捞上市之前用药防治病虫害要得当，否则影响河蟹回捕率和商品率，影响养殖效益。
外用药剂一般选择漂白粉、溴氯海因或二氯海因、硫酸锌、甲壳净即可。捕捞之前若用高氯制剂药物如强氯精（含有效氯90％左右），对河蟹刺激大，易引起不良反应，导致提前打洞或逃逸，甚至引起死亡，影响河蟹回捕率。漂白粉在所有氯制剂药物中有效氯含量最低，使用较安全。溴氯海因、二氯海因等消毒剂杀菌力强，广谱高效，持效期长，对河蟹刺激小，能有效控制河蟹生长后期病害发生，使河蟹安全成熟。硫酸锌能有效杀灭累枝虫、聚缩虫等原生动物，而且硫酸锌中含有多种矿质元素如铁、铜、硼、镁等，这些矿质元素能有效调节蟹体内外渗透压。捕捞前使用硫酸锌能使蟹体表面清爽，同时维持渗透压，从而提高商品率和回捕率。对于一些体表有"长毛"现象的河蟹，捕捞前使用甲壳净或暂养时使用甲壳净，能有效去除体表"垃圾"。
内服药剂一般选择痢特灵、氟哌酸、磷酸氢钙、生长素、复合维生素等。捕捞前河蟹摄食大量高蛋白动物性饲料，容易引起消化不良，导致肠胃炎，因此需经常服用痢特灵。氟哌酸抗菌谱广、抗菌力强，对防治后期细菌性病害如甲壳溃疡病效果明显。生长素富含从野生植物中提取的蜕皮激素以及合成激素所必需的甾醇类物质，可防治河蟹蜕壳不遂症。在河蟹成熟前最后一次蜕壳时环境条件差，容易引起蜕壳不遂，内服生长素可以提高河蟹蜕壳能力。内服磷酸氢钙能有效地补充钙、磷元素，防止河蟹因缺钙、缺磷而生长减慢。复合维生素富含河蟹生长必需的多种维生素及生物活性物质，能有效促进河蟹生长，避免营养缺乏症发生，防止河蟹食欲不振，蜕壳周期延长，甲壳不能钙质化等。
禁用药剂孔雀石绿、硫酸铜等重金属盐类药剂禁止在河蟹捕捞前使用。硫酸铜在后期使用容易引起河蟹断肢，还会影响蟹摄食和生长。孔雀石绿有致癌作用，后期使用影响河蟹品质，不能成为出口商品，同时也会影响蟹摄食和生长。
