疫苗运输、保存、稀释和使用方法不当，疫苗是特殊的生物制品，必须按其类别和性质进行运输和储藏。养殖朋友应注意疫苗的稀释和使用。例如饮水免疫时稀释液使用加有漂白粉的自来水或使用久置不清洁的井水，饮用疫苗时使用金属容器或稀释后的疫苗中含有金属离子或卤素，在稀释的疫苗中加入抗生素，饮水免疫时水的 pH值不适宜（适宜pH值应在6.8-7.4之间），应用专用稀释剂的疫苗却用普通蒸馏水稀释，在空气中打开疫苗瓶，稀释好的疫苗没在规定时间内用完等等，都会影响疫苗的质量和免疫效果。
非疫苗方面的原因环境因素如果禽舍内有害气体浓度过高，或其他应激因素使禽群处于应激状态，则应激反应能抑制免疫反应，降低免疫效果，增加对疾病的易感性。
营养因素饲料中蛋白质等的供给及机体内抗体蛋白质、氨基酸、维生素及微量元素等的正常代谢，对机体内抗体的产生起着重要作用。实验证明，在饲料中添加1.5%~3%的维生素E，新城疫HI抗体效价能提高1倍，家禽缺乏蛋白质或氨基酸时抗体合成受阻，免疫机能下降。
免疫时间不当接种时畜禽已感染或接种后尚未产生坚强的免疫保护力之前感染疾病（免疫时正处原病的潜伏期），机体对现场病原微生物不产生应答反应，往往引起畜禽发病死亡。畜禽在非健康状态下免疫不会产生较好的免疫应答。
免疫程序不合理首次免疫因母源抗体水平高而不产生免疫应答反应，或加强免疫间隔时间过长，形成免疫空白期而造成发病，或有的只重视体液免疫而忽视局部细胞免疫的，从而引发非典型疫病。
药物使用许多药物能够干扰免疫应答，如肾上腺皮质激素，能明显地损伤T淋巴细胞，对巨噬细胞也有抑制作用；抗生素中的氯霉素、卡那霉素及痢特灵等对B淋巴细胞的分化增殖有一定抑制作用。能影响病毒疫苗的免疫效果。因此，在接种弱毒活疫苗前后（3天~5天）畜禽应停止使用疫苗敏感或损伤畜禽免疫功能的抗生素，同时应避免使用消毒药饮水，或带鸡喷雾消毒。
