1.除草剂药害。药害分两种类型：一种是多种连作的老棉田，因多年使用氟乐灵且使用量偏大，造成植株茎秆细弱矮小、红茎比例占90%以上。拔下植株查看，主根不发达、侧根很少或没有，近地面的茎基部出现肿瘤，拔出植物时容易在肿瘤处断裂，剖开茎秆未见有维管束变色等病变情况。另一类是第一年种棉花的倒茬地，前茬作物为玉米。近几年使用联合收割机收获小麦，造成田间麦茬高，农民为提高除草效果，连年使用玉米田封闭性除草剂乙阿合剂或丁阿合剂。怕除草效果不好，农民惜水不惜药，人为加大除草剂用量，轻壤土亩用量应为150～200毫升之间，但农户却加大到300～350毫升/亩，多者达400毫升/亩。多年连续使用，使除草剂在田间残留，夏季多次比较大的降水，使田间除草剂随着水的流动，在低洼处积累，表现为一块地内高处棉田生长健壮正常，株高达40～50厘米，低洼处或低洼地段，植株矮小、细弱，出现红茎棉现象。
2.病害所致。个别经销商夸大品种特性、误导农民购种，农户又将购买的抗病性差或不抗病种子种在发病重的老棉田，造成低洼处或低洼地段因前期遭遇低温降雨苗病较重，长势偏弱，6月中旬两次较大的降雨诱发了枯萎病，田间为紫红型和皱缩型两种，均表现为植株矮小，生长缓慢或不长。剖开茎秆，维管束变褐，是典型的枯萎病症状。
3.盐碱害。部分地块由于长期使用化学肥料，不使用有机肥，造成土壤盐碱化或次生盐渍化，遭遇6月上旬几次小雨(降雨量低于20毫米)造成因盐分上移，盐分浓度大抑制了根系对营养的吸收，出现了盐害伤苗现象，也造成植株生长缓慢而小，红茎比例明显偏高，营养生长比其他地块明显滞后。
4.“烧苗”所致。前茬为种植玉米的倒茬地，因玉米秸秆量大，底肥仅施用磷酸二铵、钾肥或缓控释肥，未施速效氮肥。随着气温升高，雨水增多，秸秆腐烂与棉苗争肥造成棉苗生长细弱或不长的现象发生。个别植株根系下扎时，扎入秸秆内，也表现生长不良、不发侧根。出现了植株矮小、叶片小而薄的缺肥症状。
二、防治措施
1.对于多年连作病害严重的棉田。明年可和禾本科或豆科等作物搞好轮作倒茬。
2.对于已发病的矮小植株，实行偏管，喷洒甲壳素或绿亨三号杀菌剂加入氮、磷、钾含量超过50%的优质叶面肥进行喷雾，对病株进行灌根效果好于喷雾，隔5～7天再巩固一次。
3.对于连续几年使用氟乐灵的棉田，明年种植棉花时可改用乙草胺或膜上除草剂一膜灵。第一年使用氟乐灵的地块严格根据土壤状况来确定使用量，轻壤土或沙壤土亩用量不超过125毫升，重壤或黏土亩用量不超过150毫升，既不能漏喷，更不能重喷。对于玉米田应严格控制除草剂使用量：一般地块亩用量不超过150～200毫升，用水量不低于30公斤，采用低浓度高覆盖度。
4.对因秸秆量大出现“烧苗”现象的应该立即浇水，并结合浇水追施尿素12.5～15公斤/亩。
5.对盐碱化或次生盐碱化土壤通过连续几年增施有机肥加以改良，一旦出现小水“勾盐”现象，立即选用淡水浇灌压盐减轻盐害。
6.对于除草剂药害造成的植株生长不良，立即喷洒920或硕丰481加入优质叶面肥进行缓解，有条件的还要及时浇水，底肥不足或有脱肥症状的，结合浇水追施尿素7.5～10公斤，促进植株尽快生长。
7.田间植株生长不均匀的，高大植株确需喷洒缩节安化控的，应挑选大棵化控，小棵、病害株及除草剂药害株千万不可化控。
