棉苗出土前遇雨，因土壤板结影响出苗，雨后要抓紧耙地或划锄松土，发现烂种、烂芽，需及时补种、移苗。
棉苗出土后遇雨，雨后应及时中耕划锄，以提高地温，降低土壤湿度，促进根系发育。同时要及时喷药防病，可喷施恶霉灵、甲基托布津、多菌灵等内吸性杀菌剂800~1500倍液加棉花苗期专用型天达2116、天丰素等抗低温叶面肥。
低洼积水棉田，雨后要及时排水，并配合松土散墒喷施杀菌剂及叶面肥。
泥泞、病害严重的棉田，可先揭膜、松土，采取近株开沟散墒及株间松土的方法，然后用恶霉灵、菌绝、乙蒜素、多菌灵等的1000~1500倍液进行灌根，每株50~100毫升，每7天一次，连灌2~3次。
缺苗断垄处，采取缺3株补2株、缺2株补1株的方法移栽，缺苗、死苗严重的建议抓紧时间补种鲁棉研19等夏棉品种。
