秋冬季节深耕既是保证棉花增产的重要措施，也是消灭越冬棉铃虫的有效方法。据研究，棉铃虫一般在距地面2.5-6厘米(深的可达9厘米)处化蛹越冬，秋冬耕对棉铃虫具有多种杀灭作用：一是破坏蛹室，改变蛹体的自然状态，降低翌春羽化率；二是将部分虫蛹翻至地表，使其干死、冻死或被天敌啄食；三是将部分虫蛹翻入土壤深层，使其不能正常羽化出土而被闷死，从而减少越冬虫源。其技术要求是：
1.深耕时间。秋冬耕时间越早越好，一般在前茬作物收获后就要抓紧进行，在大地封冻前(冻土层超过5厘米)耕完，以延长风化时间，提高灭虫效果，并有利于多接纳雨雪。大地封冻后耕翻，不仅耕作困难，耕地质量下降，灭虫效果也差。
2.耕耙结合。深耕前先耙一遍，耕翻后再细耙碎垡，可以蓄水保墒，并能耙死部分越冬虫蛹。据调查，棉田耕前先耙，能耙死76%-85.6%的棉铃虫虫蛹，耕后蛹被埋入土壤深层，可使成活率降低86.4%-92.5%；另据山东省农科院观测，冬耕后接着耙地，春季5厘米土层含水量为16.4%，而未耙的仅为8.2%。
3.耕翻深度。秋冬深耕，耕翻深度应在10厘米以上；耕翻越深，灭虫效果越好。
4.耕后灌水。耕后接着灌水，不仅能沉实土壤，而且还能提高越冬蛹的死亡率。据中国农科院研究，土壤相对含水量在40%时，棉铃虫蛹死亡率为35.7%，成虫羽化率为40%；土壤含水量在70%时，棉铃虫蛹死亡率为46.7%，成虫羽化率为33.3%；当土壤含水量达到饱和状态时，蛹的死亡率为100%。另有资料表明，冬耕冬灌的地块，棉铃虫蛹越冬死亡率在80%左右，只耕不灌的地块越冬死亡率为60%-70%，不耕不灌的地块只有30%-40%。
另外，由于棉铃虫成虫飞翔能力强，秋冬耕必须大面积进行才能有效，除预留的棉花白茬地外，麦田套种行、果园空白地也要进行秋冬耕。
