棉花的配方施肥，也称棉花的平衡施肥，就是根据棉花生育特性和需肥规律，根据本地土壤养分状况以及对棉花产量水平的要求，施入不同种类和不同数量的肥料，使土壤中有效养分处于平衡状态并符合棉花需肥要求。经农业科研单位多年的研究和农业推广部门的实际经验，棉田氮、磷、钾的比例一般以1∶0.8∶0.6为宜，如果同时能按需配合施用锌、硼等微量元素，则效果更佳。
为了方便棉农操作，棉花生产专用肥厂家，将氮、磷、钾和微量元素按棉花生长发育的需要进行优化配置组合，棉农只要根据自己的产量要求，采取科学的施肥方法和施肥量就能达到预期目的。以亩产棉花（皮棉）100~125公斤为目标，要求棉田有机质含量为1％~1.2%，同时施用有机肥4000~5000公斤，施纯氮15公斤、纯磷12公斤、纯钾9公斤，再加上硫酸锌1.2公斤，硼砂0.5~1公斤。如果要求每亩棉田产棉花（皮棉）75公斤，则要求棉田地力有机质为0.8％~1%，施纯氮7.5公斤、纯磷6公斤、纯钾4.5公斤，再加上硫酸锌、硼砂各0.5~1公斤。为了提高肥料的有效利用率，棉田施肥要讲究施肥方法，一般要求将有机质、磷钾肥、微量元素和1/3的氮肥混合施用作底肥，结合整地进行沟施，其余2/3氮素化肥，结合浇水，在棉花盛蕾期或初花期进行追肥。
