种子在贮存期间仍不停地进行呼吸，陆续释放出水分和热量。如果这些水分和热量不能及时散发，而聚集在种子堆里，就会加剧种子的呼吸强度，而释放出更多的水分和热量，如此反复，互相促进，时间长了就会引起种子发热。
由于种子的呼吸作用，使种子堆内积聚了大量的水分和热量，这有利于微生物的生长繁殖。而在微生物活动中，能释放出更多的水分和热量，更易引起种子发热。
种子在贮存过程中，由于贮存条件不善或管理不当，会出现种子吸湿返潮现象，种子含水量越大，呼吸就越强，释放出的水分和热量也就越多，而造成种子发热。
另外，有些害虫如谷蠹之类，如果大量繁殖活动，也能促使种子发热。
防治措施
种子仓库应选择建在地势高燥，地下水位低，向阳背风的地方，仓库要具备一定的防潮和隔热性能，既能密闭保持低温干燥，又能通风，防温散湿。
种子含水量越低，呼吸越弱。在种子贮存前，应充分晾晒、扬净并严格检验，使其含水量、净度等，达到安全贮存标准后，才能入库贮存。如因天气不好等原因，没有充分晾晒，在种子入库后，应进行强烈通风，使种子含水量下降。
种子后熟期间，呼吸旺盛。因此，在种子入库贮存前，应充分晾晒，以促使其后熟作用提前完成；对后熟作用时间较长的作物种子，入库贮存初期，应进行强烈通风，以降温散湿。
种子暴晒后应充分摊晾降温，再入库贮存，以免造成种子温度过高，增强呼吸，或因仓库与种子温差大，而出现水分再分配现象，造成种子吸湿返潮。
在种子贮存期间，应加强对仓库温湿度的检查。如有异常现象，应选择晴朗天气，及时通风换气，降温散湿，并查明原因，及时采取应对措施。
在种子贮存期间，还应加强对种子温度、含水量和害虫的检查。有异常现象，应及时采取应对措施，如通风换气、深耙种子堆表面、翻仓倒囤、晾晒除杂等，以散潮降温。采用暴晒、冷冻等方法，恶化害虫和微生物的生存条件，也能直接杀死害虫和微生物。如虫害较严重或不易翻仓倒囤进行晾晒，可用磷化铝或磷化氢等药剂防治。
