确保入库种子达到安全含水量禾谷类作物种子安全含水量为12%~15%；油料作物种子为8%~10%；薯类作物种子为65%~80%。在冬贮过程中，种子水分随环境温度和湿度的变化而变化，所以要定期测定种子水分，以防坏种。
定期测定种子发芽率要根据库存的实际情况，定期、定层抽取种子样品作发芽试验，特别是在种子入库前和出库前必须作发芽试验，以确保田间用种的质量。
做好种子病虫害的检查要经常检查种子是否遭受虫害、鼠害。要采取有效措施，如喷施药剂和精选加工等方法，清除病虫害。
种子贮藏有四忌一忌用塑料袋装种子；二忌与农药、化肥混贮；三忌烟气熏蒸；四忌种子与地面直接接触。
袋贮的种子要有标志袋内外标签要一致，并注明品种、净度、水分、发芽率、来源等几项主要指标。
不能随意移动在室外贮藏的种子不能突然转入室内，室内贮藏的种子也不能突然转入室外，否则，温度骤然变化会降低种子发芽率。
