浸种的方法主要有清水浸种、热水浸种、药水浸种和微量元素浸种等。(1)清水浸种 将种子浸入到清洁的常温水中,最好是用井水,水温可调至20~30℃。种子投入到清水后,要捞去浮在水面的瘪子、果皮等物,再换清水浸泡。浸种所使用的工具和清水不能有油污,否则影响种子呼吸。浸种时水的用量不可过多,以种子全部浸没或水面略高于种子为宜。种子吸水后逐渐膨胀,等种子充分吸胀时,浸种工作结束,再反复多次搓洗,除去种皮外的粘液,用清水洗净。晾干后,以手摸清爽,不粘手,籽粒间不粘连为度。辣椒浸种时间为8~12小时,浸种时间的长短与水温有关,在一定范围内,随温度的增高,种子的吸水速度也加快。(2)热水浸种 热水浸种前,先将种子放在常温水中浸15分钟,可促使种子上的病原菌萌动,易烫死,然后将种子投入55~60℃的热水中烫种15分钟,水量为种子体积的5~6倍。烫种过程中要及时补充热水,使种子受热均匀,要不断搅拌,直至水温降到30℃左右时才可停止搅拌,也可在达到烫种时间后将种子转入30℃的温水中继续浸泡4小时。处理时要用温度计一直插在热水中测定水温,以便随时按要求调节。种子量较少时,可先将种子装在纱布袋中,烫种时连袋浸入水中,达规定的时间后可迅速将种子转入30℃的温水中继续浸泡;种子数量较多时,可用细孔网篓代替纱布袋。(3)药水浸种 采用药水浸种时,应严格掌握药水的浓度和浸种时间。种子浸入药水前,要用温清水先预浸4~5小时,种子在药水中浸过后要立即多次用清水冲洗。① 硫酸铜浸种:先将种子用清水浸4~5小时,再用1%的硫酸铜溶液浸5分钟,取出种子用清水冲洗干净后再播种或催芽,或用1%的生石灰浸一下,中和酸性后再播种。也可以取出种子阴干后,拌少量熟石灰粉或草木灰,中和酸性后再播种。该法对防止炭疽病和疮痂病的效果较好。②升汞水消毒:先将在清水中浸泡过4~5小时的种子,用0.1%升汞水消毒5分钟,取出种子用清水并且冲洗干净,再催芽、播种或晾干备用。该法对防治疮痂病效果较好。③链霉素液浸种:已在清水中浸泡4~5小时的种子,用1000毫升/升的农用链霉素液浸种30分钟,水洗后再催芽。该法对防止疮痂病、青枯病效果较好。④磷酸三钠浸种:将已清水浸泡过的种子,用10%的磷酸三钠水溶液浸种20~30分钟,浸后用清水冲洗干净。该法对防止病毒病效果较好。⑤1%次氯酸钠浸种:5~10分钟,种子经药剂处理后要用清水淘洗数遍,然后置于常温水中浸种8~12小时。⑥微量元素浸种:用0.002%的硼酸或0.02%的硫酸铜、硫酸锌、硫酸锰等溶液浸泡辣椒种子5~6小时。有促进早熟、增产的作用。