一是恢复了菌种原有的生物特性
多年以来，许多菇农朋友从各个菌种供应点买回的菌种，明明介绍的是黑蘑菇，种出来却变成了白色的，造成了不少损失。究其原因，除了供种单位管理混乱、职业道德差等因素外，主要原因就是菌种在长期的保存、转管、再保存、再转管的频繁转扩过程中，不可避免地沾染了病毒、病菌，从而使菌种发生了退化或者变异。
二是抗性得到了增强
在脱毒过程中，采取一系列的高低温锻炼、营养贫乏等技术手段，迫使菌株适应恶劣的条件，在“优胜劣汰，适者生存”的竞争机制下能够适应且表现良好的都是能够提高抗性的好菌株。
三是抗病性提高了
经过近10多年推广，结果表明，脱毒菌种较之普通菌种发病率下降６0％以上。近年生产中发生严重的黄斑病、褐腐病等给广大菇农朋友造成了巨大的经济损失，使用脱毒菌种后发病率明显下降，大大提高了菇农的生产效益。
