玉米种子收获初期，含水量较高，经过一段时间的自然风干或机械烘干，使种子含水量逐渐地降下来。但在10月中下旬寒冷的天气到来之前，含水量必须降到种子所要求的安全水分，也就是含水量必须降到14%以下，种子才能够安全过冬。提高种子质量如种子中含有较多的不成熟或破碎的种子，以及其它大量的尘土杂质等，都会给种子安全贮藏带来不良后果，在贮藏中一定要注意保持种子的纯度和净度严格控制温度如种子含水量达到安全水分的要求，种子成熟度又好，是能够长期忍受最低温度对其侵袭的，这样的种子可以长期贮藏在干燥的冷库里，而不影响其发芽能力。如果玉米种子含水量在14%以上，就要采取有效的管理措施，这样的种子要保存在温度在零度以上的环境里，一直到来年播种，温度都不得低于零度。
保持良好通风玉米种子具有明显的吸潮性，即使是干燥的种子，遇到雨淋、雪的覆盖或烟气的熏蒸，都会出现反潮现象，也会降低玉米种子的发芽率。所以不要就地堆放，必须垫底防潮，要把装有种子的麻袋或其它容器用木料或砖垫离地面50厘米以上，室内要保持干燥通风良好，即使种子经常处在干燥的状态中，也要经常进行人工能风。
严格定期检查根据不同季节，对保存方法、含水量、温度、发芽率等情况进行定期检查，重点检查三个方面：一是检查种子是否受潮湿；二是检查种子是否被虫蛀、鼠咬；三是定期检查种子的发芽率和发芽势。因种子冬贮时间是较长的，在整个种子贮藏过程中，种子自身的含水量受空气的温度和湿度的影响，都可能发生较大的变化。
