秸秆粉碎还田机在使用前应将变速箱内加注4千克至4.5千克的30号齿轮油，与主机挂接完毕后，将机具升离地面，用手扳动粉碎滚筒或用杠杆插入万向节传动轴节叉内转动。检查各转动部件转动是否灵活，有无碰撞异音，各紧固件是否牢固可靠，确认无异常再缓慢结合动力，转速由低到高空转运行。如果发现强烈震动、摩擦碰撞等异常现象应立即停车排除，正常后需高速运转5分钟至10分钟方可投入作业。注意在空运转或作业时，机具前后严禁站人，防止事故发生。
田间作业及运输
田间作业时将液压分配器手柄置于“浮动”位置，待留茬高度确定后，将油缸定位箍调到一定位置固定好，然后缓慢结合输出动力，待滚筒高速运转正常后，再落地起步作业。作业中如遇较大土埂、水沟或机具倒退时，应将整机升离地面。
作业时应尽量避开障碍物，更不得使锤爪碰击砖头、石块等坚硬物质。运输时将整机升起，切不能把限深滚筒当行走轮使用。
留茬高度调整
把整机提起，拧松限深滚筒紧固螺栓，并将前边螺栓取下，在上下三个孔内任意调整。向上调留茬高度增加，向下调留茬高度降低，调整后螺栓必须紧固。也可增长拖拉机升降中拉丝，使留茬高度增加，反之则降低。但须注意，不允许粉碎锤爪或刀片入土作业，否则会加重作业负荷，加快锤爪磨损，减少机具使用寿命。
三角带松紧调整
调整三角带松紧，主要靠调整张紧轮架上的调整拉丝来保证。如三角带过松可把张紧轮架上螺母向内调整，三角带过紧可向外调整。调整合适后，两对螺母必须锁紧。提醒使用者注意的是三角带应松紧适当，不可过紧，以机具工作时三角带无明显打滑为宜。
变速箱齿轮啮合位置调整
大小锥形齿轮正确啮合侧隙为0.15毫米至0.35毫米。用涂色法检查齿轮啮合的接触斑点，其啮合斑点的高度不小于齿高的40%，斑点宽度不小于齿轮宽度的40%，接触斑点不符合要求时采用增加或减少调整垫片的方法进行调整。
