不宜表土撒施碳铵易挥发流失损氮，据测定：在气温28℃时，表土撒施碳铵12小时内损失氮素20%，而深施10厘米处盖土时，12小时内损失氮素不到1%，同时碳铵表施还容易被杂草消耗，所以肥料的利用率仅有30%左右;深施融肥于土，肥料利用率可提高20%~30%。
不宜作种肥施碳铵具有较强的腐蚀性和挥发性，对种子有强烈的腐蚀作用。用它作种肥或拌种，对种子发芽和幼苗生长会产生严重危害。要作种肥，只能开沟穴施，不和种子接触。
不宜叶面喷施碳铵易溶于水，溶后分解成铵离子，对作物叶片有烧伤、熏伤的危害，造成叶片斑斑点点的损失。喷施的肥液浓度高、用量多，还会造成作物毁坏，需要进行补种或耕翻再种。故碳铵不可进行叶面喷施，适宜土壤深施，与有机肥混施。
不宜烈日追施碳铵最大的弱点是易挥发失氮，其挥发的速度与温度高低成正比。据测定：碳铵在空气中放置15天，气温在12~14℃与16~18℃时，分别挥发失氮60%和95%;在28℃时，7天内全部氮素挥发损失。所以碳铵不宜在晴热天高温烈火日下施用，应在上午10时前无露水和下午5时后，气温较低时施用，避免烈日直射下施用造成氮素损失。
不宜有露水施在早晨或雨后作物叶片上有水滴、露水未干，不可追施碳铵。碳铵腐蚀作用强，若肥液沾在有水的叶片上，容易烧伤叶片，造成植株损伤。
不宜碱肥混施碱性肥料有草木灰、钙镁磷肥、石灰等，碳铵不可与这些碱性肥料混合施用，否则会造成碳铵中氮变成氨气挥发，肥效损失快、浪费严重。
不宜与过磷酸钙混合过夜再施碳酸氢铵与过磷酸钙混合施用，虽然比分别单施效果好，但混合后应立即施用，不宜久放，更不能过夜。因为过磷酸钙吸湿性强，会使混合肥料变成浆状或结块，不利施用，且碳酸氢铵挥发性强，易挥发损失。
不宜与尿素混施碳酸氢铵施入土壤后，造成土壤溶液短期呈酸性反应，会加速尿素的挥发损失，故碳酸氢铵不能与尿素混合施用。
不宜与菌肥混施碳酸氢铵施后会释放出氨气，与菌肥接触，会使菌肥中的活菌体死亡，使菌肥失去效果。
