杂交水稻施肥的确与其他农作物施肥不同。从总体上说，应该是有机肥、磷肥作基肥，钾肥主要作分蘖肥，氮肥采用多次匀施，特别注意施好壮苞、壮籽肥。具体应注意以下几点：
(1)基肥的施法。据测定，杂交水稻总吸肥量中50%～60%的氮素和70%的磷、钾来自土壤，施肥不足就会过多消耗土壤潜在养分而降低地力，增施有机肥是维护和提高地力的重要途径。使有机肥施用量占全期施肥量的40%。
(2)适量早施分蘖肥。由于杂交水稻根系活力强，插后新根发生较快，一般早稻在插后5天，晚稻在插后3天，即可追施尿素等促进分蘖，分蘖肥宜分次施用，第一次每亩施尿素6～7.5千克;隔7天左右，根据苗情，对生长差的田块，补施第二次蘖肥，亩施尿素4千克以内。对施有机肥少和缺钾肥的田块，每亩追施5～7.5千克钾肥。
(3)看苗施用穗肥。穗肥因施用时期和作用不同，可分为促花肥和保花肥。凡是前期施肥适当、禾苗长势平衡的，一般应以保花增粒为重点，只施保花肥而且施用量不宜过多，一般每亩施用尿素2.5千克左右。如果前期施肥不足，群体苗数偏少，个体长势效差，那么促花肥与保花肥都可施用，每次每亩可施用尿素5千克。杂交水稻对钾肥需求量大，晒田复水后结合追施氮肥，每亩追施2.5千克左右钾肥，增产效果显著。
(4)看苗施用粒肥和叶面追肥在始穗前。禾苗叶色过淡的，每亩撒施尿素2～2.5千克;齐穗后过早落黄的田，每亩施尿素2.5～3千克;生长正常的杂交稻，只宜用500～750千克尿素兑水50千克喷雾作粒肥。由于杂交稻后期对磷钾的吸收量较高，因此后期施叶面肥有良好的增产作用。在始穗前4～6天或齐穗后2～3天，用磷酸二氢钾150～200千克兑水50千克对生长差的禾苗喷施，有增强植株抵抗高温或低温的能力。
