秋季苹果园采果清园后，应立即施用基肥。秋季施入的基肥多以粪肥、堆肥、秸秆等有机肥为主，配施适量氮磷钾速效肥或苹果专用肥，做到改土与供养结合、迟效与速效互补。施化肥时注意氮、磷、钾的施用比例，不宜施用过多的速效氮肥，否则易引发冬梢。同时，要有针对性地配施微量元素肥料。沟施法和盘施法均可。沟施，在树冠滴水线位置开挖环形或长方形或弧形施肥沟，沟深40～50厘米，沟宽视施肥量多少而定，沟底宜平。沟内淋水后施入干性肥料，水干后盖土。施肥前将露在沟内的树根沿沟壁剪平，剪口要平滑，防止根系发霉腐烂。施肥时肥料要逐层施入，将树叶、杂草等铺在底层，最上层施有机肥，每施一层肥覆一层土，肥土高于地面25～30厘米。成年树根群在果园交错分布，可采用盘施法施肥，即在植株一侧沿株距或行距将表土耙开，近树干处宜浅耙(深7～10厘米)，距树干较远处宜深耙(深40～60厘米)，耙后施肥、覆土。
