提高农家肥质量的关键，是在施用前采取高温堆积的方式使之腐熟。在堆制过程中，物料发酵能使温度达到55—70℃，利用腐熟过程中产生的高温，可杀死废弃物中的病原微生物、虫、卵及杂草种子等，并对有害物有降解作用。
富含有机质的农家肥，其养分形态绝大多数是迟效性的，作物不能直接吸收利用，如果把未腐熟的有机肥料施入土壤中，往往由于分解很慢，不但当即肥效差，同时还会滋生杂草和传播病菌、虫卵等，因此使用前采取高温堆积的方式使之腐熟。农家肥腐熟不仅释放了养分，提高肥效，而且避免肥料在土壤中腐熟过程中产生对农作物不利因素，如与幼苗争夺水分，养分或因局部地方产生高温，氨浓度过高引起烧苗，只有腐熟的有机肥料才有显着改善土壤性质的作用。
