在水稻的种植中，施用有机肥后，在微生物的作用下，一方面矿质化为作物吸收的营养元素，另一方面腐殖化为腐殖质，改善土壤的物理性状，调节土壤水、肥、气、热状况，使土壤疏松易耕，变瘦土为肥土，变坏土为好土。
稻田连年种植
每年不但要从土壤中吸收走大量的氮、磷、钾三要素和一定量的钙、镁、硫、铁等元素，而且还要吸收少量的氯、锌、锰、硼、铜、钼等微量元素，大约为氮的10倍，大量的多种营养元素被吸收，还有一部分被淋溶损失，仅靠无机肥料补充远远不能满足水稻生产需要。必须实行有机肥料和无机肥料配合施用。
施用有机肥料
不仅可直接为水稻提供各种丰富的养分，而且还能在土壤微生物对有机物质的分解过程中，使一部分有机质起腐殖化作用，合成土壤腐殖质，这对改善土壤物理性和结构，增加土壤胶体的数量与品质，提高土壤保肥供肥能力方面有很大效果。
