造成土壤缺素严重花的根有大量的根瘤菌，对氮素不太敏感。由于连作，导致土壤缺素而满足不了花生所需的营养，从而影响花生正常生长和发育。表现出越来越严重的缺素症。而新茬种植的一般不会发生缺素症。
导致病虫害危害严重花生青枯病、病毒病、根线虫病、叶斑病等，大都由于土壤带菌传病的，连作时间越长，土壤中的病株体积累越多，花后染的机率就越高。而新茬种植的花生则发病轻或不发病。
影响自身对养分的吸收花生在生长发育过程中，其根系不断分泌较多的有机酸，这种有机酸虽然能溶解土里的矿物质，但连作必然导致土壤中有机酸积累过多，
对花生根系发达造成极为不利的土壤环境，影响了花生根系对养分吸收能力，使株矮小，抗病能力差。
使花生品质差产量低花生连作座果率低，饱果率少，花生仁细小甚至瘪粒。试验表明，花生连作两年，减产8%~10%，连作三年减产25%~30%，连作四年以上减产50%以上。
