从近几年套袋苹果出现的问题看，不论套纸袋还是套塑膜袋的果，黑点病发生最严重。
黑点病发病初期，果实萼洼周围出现针状小黑点，黑点直径逐渐扩大，有的如芝麻大，有的像绿豆大。病斑只发生在果实表皮，口尝无苦味，不会引起果肉溃烂，贮存期间也不扩展蔓延。
还有些与黑点病相似的病害，果农一定要区别开。有些黑点分布在萼洼上部和果顶周围，胴部也有，黑点一发生就成较大的斑点，只为害皮层，口尝有苦味，也不会引起果肉溃烂，在生长后期和贮存期黑斑扩大，并稍凹陷，此病为缺钙引起的痘斑病，严重时和苫痘病并发。有的浅褐色斑点，在果面上分布无规律，病斑较大时，病部溃烂，扩展快，会造成整果溃烂，病烂处口尝有甜味，此为轮纹烂果病。有的果点粗大暴裂，呈黑点状，多是含铜、锰离子或乳剂类药物刺激所致。
黑点病主要发生在6月下旬至7月下旬，雨季进入发病高峰。连阴天气、地势低洼、树冠郁闭、树势较旺、施氮肥多的果园发病重。据最新研究表明：套袋苹果黑点病病源是链格孢菌和粉红聚端孢菌。黑点病的致病菌和苹果霉心病、斑点落叶病的致病菌基本一致。套袋果比不套袋果黑点病发病重。黑点病的致病菌为弱寄生菌，一般不侵染果面。套袋果处在湿度大、透气差、温度高的条件下，易引起病菌浸染发病。不论是纸袋，还是塑膜袋，下雨后袋内积水，不能较快排除，纸袋湿后长久不干或袋底的底角排水口未鼓开时都会加重黑点病的发生。
防治苹果黑点病套袋前正确用药最关键。可用多抗霉素、农抗120、菌立灭等，在花后和套袋前连喷2～3次。若喷大生、喷克等代森锰锌类保护性杀菌剂，喷晚了不行。甲基托布津等渗透性杀菌剂对轮纹烂果病有效，对黑点病无效。波尔多液和其他含铜离子的杀菌剂套袋前都不宜使用，而且对黑点病无效。杀菌剂的药效期一般10天左右，套袋前喷药间隔期不要超过10天，脱袋后不要喷任何有毒的药剂。
