1.出现群菇 播种量过大，播种不均匀，会导致出现群菇。所以，播种量宜控制在0.2～0.3千克/平方米。
播种方法可采用层播、混播或撒播，最好不用穴播。
2.菌种老化 若是使用了老化的菌种，虽菌丝的萌发和定植都正常，第一潮菇产量也不错。但第二、三潮菇产量明显降低，总体产量降低。因此，购买菌种时，必须注意。
3.温差过大导致小菇蕾死亡 草菇在子实体发生期间，通风和喷水管理，都必须使栽培环境尽量维持恒温，通风只能缓缓进行，并且密切注意气候的突然变化，大风天严禁开窗通风。喷水时也要注意使用的水温与室温一致。
4.培养料酸化 酸化的培养料，菌丝生长稀弱无力，无光泽感，子实体发生既少又小，且易破膜开伞。同时鬼伞却大量发生。防止酸化的方法，除在配制培养料时注意调整好pH值之外，还应将播种后的水分管理，改为喷0.5%石灰水。
5.蹋料 过松的培养料，蹋料现象严重，造成菌丝断裂，培养料变薄，出菇量减少。所以在上床和播种后，一定要注意将培养料略为压实。若是堆垛法栽培.堆形宜低不宜高。
6.病虫害 使用变质原料或培养料发酵、消毒等预处理不彻底，或在不卫生的场所栽培，皆可导致杂菌和害虫大量滋生。使床面幼菇大量死亡、僵化腐烂或致畸。
