如果在同一块田地连续多年种植同一种或同一科作物会不同程度的引起产量下降、品质变劣、病虫害滋生、生育状况变差等现象，此现象有专业称之为连作障碍。连作危害在蔬菜栽培上最为常见，也最难克制。究其原因是多方面的，主要有以下四大因素：
一、作物自毒作用。某些作物可通过地上部分淋溶、根系分泌和作物残茬腐解等途径释放一些物质，对同茬或下茬或同科作物生长发育产生抑制作用，这种现象叫自毒作用。
二、土壤有益微生物减少、有害微生物增加。由于连作，形成了特殊的土壤环境，使固氮菌、根瘤菌、光合菌、放线菌、硝化菌、氨化细菌、菌根真菌等有益微生物的生长繁殖受到抑制，而有害微生物大量滋生，土壤就会发生变化。
三、土壤性质变坏，次生盐渍化及土壤酸化严重。为了片面的追求高产，大量施入高含量的化学肥料和未经腐熟的动物粪便、人尿粪等，导致土壤中盐分过量。
四、线虫危害。线虫是作物寄生虫，主要破坏作物的根系，影响其正常生长，而且防治难度大。
农作物连作危害的防治：
一、施肥：测土配方，平衡施肥，调节营养，以有机肥为主，有机肥和无机肥相结合。
二、管理：轮作间作，优种嫁接。
三、栽培：土壤消毒，药治菌补。
