黄芪为豆科多年生草本植物，以根入药，有补气固表、利尿脱毒等功能。目前主要栽培种类有膜荚黄芪(东北黄芪)和棉芪(蒙古黄芪)，主产于黑龙江、山西、内蒙古、甘肃和吉林等省，其他各省也有引种。黄芪病害地上部有白粉病、褐斑病和锈病，地下部有立枯病、紫纹羽病、白绢病和根腐病等。其中发生普遍、危害最重的是白粉病、锈病和紫纹羽病。
1.黄芪白粉病
主要为害叶片，也可侵染叶柄、茎和荚果。叶片最初产生近圆形白色粉斑，迅速扩大成片，上面布满白色粉末状霉层，为病菌产生的菌丝体、分生孢子梗和分生孢子。严重时叶背及整株被白粉覆盖。后期白粉变灰白色，霉层中产生黑色小颗粒，即病菌的闭囊壳。该病在黄芪产区普遍发生，造成叶片枯黄变褐早落。
黄芪白粉病由子囊菌亚门白粉菌目白粉菌属真菌所致。以闭囊壳随病株残体在田间地表越冬，来年5—6月份在适宜的温湿度条件下，闭囊壳吸水后释放出大量子囊孢子引致初侵染发病。菌丝可在黄芪芽上越冬，来年也可侵染发病。病斑上新产生的分生孢子经气流传播引致多次再侵染。白粉病菌在10℃—30℃以及25%以上的相对湿度均可侵染发病。分生孢子萌发不需要水滴条件，相反，水滴的存在会使分生孢子因吸水过多而使孢壁破裂。干旱会降低植株对白粉菌的抗病性，所以温暖季节有一定湿度时会大发生。每年5—6月开始发病，9—10月发病率可达100%。过于高温干旱和过多降雨会减缓白粉病的危害。施肥不足或氮肥过多、土壤缺水或低洼排水不良、管理不善、环境荫蔽、光照不足等造成植株生长衰弱，白粉病发生严重。
防治方法，彻底清除病残体，加强栽培管理，合理密植，注意株间通风透光，增强植株抗病性。选用新茬地种植，避免与豆科植物连作及在低洼潮湿地块种植。施肥应以农家肥为主，化肥氮、磷、钾的比例应合理搭配。发病前或发病初期应进行药剂防治。可用62.25%仙生600倍液、25%粉锈宁800倍液、70%甲基托布津800倍液或50%多菌灵600倍液喷雾，也可喷波美0.3度石硫合剂。7—10天喷施1次，连喷3—4次即可。
2.黄芪锈病
主要为害叶片。病叶正面出现褪绿色斑，背面淡黄色小疱斑。疱斑表面破裂后露出锈黄色夏孢子堆布满全叶，后期产生深褐色冬孢子堆。发生严重时导致叶片枯死。
黄芪锈病由担子菌亚门锈菌目单胞锈菌属真菌所致。病菌有转主寄生现象，性孢子和锈孢子阶段寄生于大戟属植物，在芦头病残叶内存活越冬。生长季节以夏孢子反复侵染危害。锈病在东北地区7—8月为盛发期。田间种植密度过大、氮肥过多、高湿多雨有利发病。
防治方法，选择排水良好、向阳坡、土质深厚的砂壤土种植。彻底清除田间病残体，降低越冬菌源基数。发病初期及时喷药防治，可用25%粉锈宁600—800倍液、62.25%仙生600倍液、80%代森锰锌600—800倍液喷雾，或用敌锈钠喷雾防治。
3.黄芪紫纹羽病
主要为害1年生以上的植株根部。发病从小根开始，逐渐向主根蔓延。病根初期形成不明显黄褐色斑块，外表较正常的根皮略深，内部皮层组织则变褐色，病健交界明显。菌丝层及菌索的色泽较红，后逐渐变紫，药农俗称“红根病”。根表面着生1—2毫米半球形暗褐色菌核。后期病根皮层剥离，木质部腐朽。秋后在病根表面及土壤缝隙处可见到大小形状不定的菌丝块。病株叶片黄化，生长衰弱或枯萎死亡。
黄芪紫纹羽病由担子菌亚门木耳目卷担菌属真菌所致。病菌寄主范围广，药用植物中除危害黄芪外，还可危害黄连、党参、桔梗、巴戟天、北沙参、丹参、紫苏等。病菌以菌丝体、根状菌索或菌核在病根及土壤中残留越冬，并可存活多年。遇到寄主首先侵染细根的柔软组织，引起软化腐烂，而后蔓延到主根。病菌主要靠病健根接触、菌索的扩展而传播，灌溉水和农具等也能传播。担孢子在雨季形成但寿命较短，不能起传播作用。在新开垦的生荒地和树林边迹地黄芪发病重。根部被牲畜践踏受伤、长势衰弱的植株以及土壤偏酸性的易发病。黄芪整个生长季节都能发生病害，以8—9月症状最为显著。
防治方法，紫纹羽病菌在土壤中能存活多年，寄主范围又广，不易根除。防治上主要是加强栽培管理，增强生长势和提高抗病力，并进行土壤消毒。山林迹地栽培，应尽量清除土壤中的残留树根，不用林间土渣肥作基肥。合理安排与非寄主植物轮作。每667平方米施石灰100公斤以中和土壤酸性，防病效果良好。发现病株立即清除销毁。用70%甲基托布津1000倍液、50%苯来特1000—2000倍液或多菌灵等药液浇灌。病土处理可施用石灰氮(20—25公斤/667平方米)消毒，但必须早期(2周前)耕翻入土壤中，使其有效成分氰氨分解成尿素后才可种植。要合理灌排，防止人畜踩踏伤根.
