(1)注意寻找和培育抗病品种 有人曾对烟属的28个种进行接种测定，结果表明：N. tabacum 和N. rustica 表现感病;而N. repanda 、N. debneyi的一个品系和N. repanda × N. sylvestris的双倍体则表现免疫。从国内本病发生情况来看，广东高鹤的白肋烟、广东农科院经作所培育的香料烟都比较感病，无论南方烟区和黄淮烟区所种植的品种都不抗病。这表明，我国现阶段烟草生产尚无可供利用的抗蛙眼病的品种，寻找和培育抗病品种实属当务之急。
(2)抓好栽培防病 ①收获后彻底清理病残体，秋冬深耕翻土。②实行2~3年的轮作制。③提倡薄膜育苗，早育苗、育壮苗、早移栽。④加强肥水管理。实行配方施肥，避免钾肥不足而氮肥过多，适时喷施叶面肥，增强植株活力，防止早衰;高畦深沟，雨后及时排渍降湿;适时“打顶”和清除脚叶，防止叶片早衰。⑤及时采收，避免叶片过熟。
(3)及时烘烤，改小火期传统温度(30~32℃)烤烘为高温(38~41℃)烘烤，并改善排湿，以免烤烘期病斑继续扩大。
(4)及早喷药预防控病 苗期定期喷药保护，带药移栽，发病初期喷药控病。用药除参照烟草赤斑病防治外，还可喷施77%可杀得悬浮剂800倍液或65%多克菌可湿粉800倍液。并注意防治烟草根结线虫病。
