在杏根癌病病原菌发病之后，通常是在杏树的根、根颈以及茎部产生癌瘤，其实主要是以根颈长出的大根最多，有的分散在整个作物的根系上，受到危害的部位将会产生大小不相等，形状不一的肿瘤，小的像豆粒，大的像核桃、拳头，或是若干个瘤簇生形成一个大瘤。起初会生活癌瘤光洁柔滑，大多是呈现为乳白色，也有的表现为微红色，之后逐渐变成褐色至深褐色，变硬木质化，表面比较粗糙。到了后期癌瘤表现为深黄褐色，容易脱落，在表面的组织容易破裂，腐烂，出现腥臭味，在老熟的癌瘤脱落处，又可以产生新的癌瘤，发生病害的植株因为根部产生癌变，水分、养分吸收输导将会受到阻扰，土壤上部生长发缓慢，树势比较衰弱，叶薄，色黄，细瘦，在病情严重致使整个植株萎蔫干枯死亡。
杏树根癌病是为根癌土壤杆菌，属于一种细菌性的病害，病原菌将会根瘤以及土壤中过冬，能够存活一年以上，病原菌侵染开始在种子萌发阶段，也可以侵染到受到伤害的根系，经常是在根的皮孔处形成小瘤，比较难以察觉。传播此病害的主要载体是雨水、灌溉水、地下害虫、线虫等，其中进行远距离的传播的主要途径是为苗木，细菌主要是从嫁接口、机械伤、虫伤以及气孔侵入到作物根部，在入侵之后将会刺激四周细胞，使分裂加速，产生癌瘤。在病原菌入侵到癌瘤产生，病程差异非常大，少的几周，多的在一年以上。
防治此病害的措施如下：
1、增强植物检疫。引种杏树苗木，应该严格产地检疫，选择使用无病田起苗，若是发现病苗应该予以淘汰，避免苗木带有病菌而传播。
2、对苗木进行消毒处理。在苗木定植之前选择使用百分之零点三到百分之零点四的硫酸铜溶液进行浸泡苗木根系约1小时，或是选用百分之一的硫酸铜液进行浸根5分钟，百分之三的次氯酸钠溶液进行浸根约3分钟，之后冲洗干净，或是使用3到5波美度石硫合剂进行整个植株喷药消毒。
3、进行土壤消毒处理。平均每平方米使用硫磺粉50到100克或是漂白粉100到150克进行土壤处理，或是每坑使用1.5公斤到2公斤的石灰进行杀菌消毒。
4、增强肥水管理。增加施用有机肥，氮磷钾配合，培育健壮幼苗，合理负载，降低大小年发生，提高树木自身的抗病能力，延缓树木发病。
5、化学农药治愈。若是在田间发现病害植株，需要不失时机使用快刀将病瘤切除，之后使用100倍硫酸铜稀释液或是使用200倍杀菌王溶液消毒处理，再外涂抹波尔多液进行保护，对切下来的病瘤应该及时的集中烧毁，避免传染。对发病严重时病株应该及时的拔出就地烧毁，对病株四周的土壤使用抗菌剂402稀释2000倍液，84消毒液500倍，或是使用杀菌王300倍液添加15克恩益碧添加10克天然芸薹素灌根进行防治，每株灌15公斤到30公斤，连灌2到3次，可以有效的控制发病。
