一、农业防治 (一)选用抗(耐)病的丰产良种。抗晚疫病的秋延后番茄可选用中蔬4号、强丰、佳粉10号等，冬春茬番茄可选用早丰、早魁、丽春等早熟品种;抗病毒病的秋延后番茄可选用强丰、中蔬4号、5号、毛粉802、毛粉808、毛粉818等，冬春茬番茄可选中杂4号、佳粉1号、西粉3号等;抗早疫病的，可选用强丰、西粉3号、皖红1号等;抗叶霉病的，可选双抗2号、佳红等。这些品种具有较好的丰产性和抗(耐)病性，可因地制宜选用不同品种。(二)轮作换茬减少病虫来源。合理轮作，改善土壤理化性质、培肥地力，消灭病虫来源，减轻病虫害发生。轮作时，番茄应避免与茄科蔬菜轮作、可与草莓或葫芦科蔬菜轮作。(三)合理施肥。注意使用有机肥，增施磷钾肥，一般每亩施用农家肥5000公斤以上，磷酸二铵25公斤左右，或配施磷酸二氢钾7.5公斤左右，增强番茄植株的抗病力。(四)培育无病虫壮苗。大力推广使用营养钵、营养块、穴盘育苗。育苗基质配制：干净的菜园土50%，腐熟的堆肥或农家肥45%，过磷酸钙5%。如用苗床育苗，育苗前按每平方米苗床用土壤消毒散6克加10～15公斤细土拌匀，播种时先把1/3的药土撒到床面上，剩下的药土在播种后撒施，最后覆土，并喷适量水，保持苗床湿润，可防治多种病害。定植前，若发现病株应立即拔除，发现病虫要及时消灭。(五)高畦深沟栽培，加强田间管理。实行窄畦、深沟、高垄栽培，做到三沟配套，排水良好，切忌大水漫灌。在生长前期，田间以湿润为主，中后期见干见湿。最好全膜覆盖，采用滴灌技术灌溉，在定植幼苗后，垄面及暗灌沟用超薄膜覆盖，采用软管、渗管等滴灌技术灌溉。
二、生物防治 (一)以虫治虫。自然界中天敌的种类很多，如瓢虫、草蛉、食蚜蝇、寄生蜂、寄生蝇等，它们可以捕食或寄生蚜虫、粉虱、地老虎、棉铃虫、烟青虫的成虫、卵、幼虫(若虫)和蛹。(二)以菌治虫。如白僵菌、青虫菌、杀螟杆菌、Bt乳剂、农用链霉素、新植霉素、5%的井冈霉素、氯霉素等，能防治番茄上的多种病虫。(三)利用黄黏板、黄黏筒、银灰色膜来诱杀蚜虫、自粉虱的成虫。还可利用防虫网，来防治多种害虫。
三、药剂防治 (一)防治害虫。在害虫的低龄阶段喷药，使用药剂可选择2.5%的敌杀死乳油2000倍液，或200%的速灭杀丁乳油2000倍液，或200%的灭扫利乳油2000倍液。(二)防治病害。在病害发病初期喷药，使用的药剂有65%的甲霉灵600倍液、50%的多霉灵700倍液、64%的杀毒矾500倍液、58%的瑞毒锰锌600倍液、50%的农利灵1000倍液、50%的敌菌灵500倍液。喷药后应注意放风降湿，并适当控制浇水。也可每亩地用10%的速克灵、45%的百菌清烟剂250～300克，棚内分布8～10个点，用暗火点烧后封闭大棚，熏烟3～4小时进行防治。
