近年来,随着柴胡栽培面积迅速增加,病害问题日益突出,以根腐病较为常见,是目前对柴胡为害最为严重的病害之一，导致药材产量降低, 品质下降。
柴胡根腐病症状：多发生在高温多雨季节。发病初期，只是个别支根和须根变褐腐烂，后逐渐向主根扩展，至全部腐烂，只剩下外表皮。最后植株成片枯死。
柴胡根腐病的病原：为尖孢镰刀菌和腐皮镰刀菌，属半知菌亚门真菌。是一类世界性分布的真菌，分布极广，普遍存在于土壤及动植物有机体上，可以在土壤中越冬和越夏，病部组织变硬、变脆，裂口深及木质部并造成水分、营养运输中断，导致整个植株萎蔫死亡，田间一年生柴胡在当年秋季地上部枯萎后即有发生，二年、三年生柴胡在5-8月份为高发期。
栽培中氮肥施用过多，以及偏酸性的土壤有利于病菌的生长和侵染，会促进病害的发生和流行。
柴胡根腐病防治方法：
1、选择抗病的优良品种。
2、轮作倒茬，防止因连作引起病原菌的积累。
3、及时拔除病株，田间发现病株时及时拔除并销毁，减少病菌的进一步扩散。
4、合理控制栽培密度，加强通风透气，防止积水。
5、药剂防治：在5-8月份发病高发期使用阿米西达3000至5000倍、卉友(Medallion)4000至5000倍、苯醚甲环唑或恶霉灵、多菌灵灌根或喷雾处理。(药剂使用请慎重，先试用，防止药害发生)。
6、合理施肥：从预防柴胡根腐病的角度,在第二年拔节前应多施磷肥,适量施用氮钾肥。
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