辣椒根部病害发生后常造成辣椒死棵，严重者成片死亡，甚至绝收。所以要及时处理才能保证收益。辣椒根部病害综合防治措施如下。
全棚消毒处理清洁田园，特别是将病株残体彻底清理干净。用848消毒液200倍或者消菌灵1000倍液喷洒地面，喷匀喷透。可以杀死土壤中残存的病毒、真菌、细菌，有效抑制土传病害的发生。
经研究发现，土壤病原菌大多喜欢酸性环境，特别是青枯病原菌，可以根据棚中土壤酸碱度进行适当调整，酸性土壤可亩施120斤左右的生石灰，改变有害微生物的生活环境，抑制土传病害发生。
定植时土壤消毒处理50%乙磷铝锰锌、30%DT各1公斤加20倍干细土配成药土，在定植时均匀撒于2000棵植株的穴内。只要做到苗床土消毒和定植穴内用药，可有效控制根部病害的蔓延发生。
药剂灌根处理定植缓苗后植株发病，可以采取药剂灌根的防治方法。将50%乙磷铝锰锌500倍液加30%DT500倍液再加枯腐立得500倍液混合一起后，进行单株灌根，用液量为每株0.25?0.5公斤。灌根10天之后方可浇水，否则会加重病害的蔓延发生。
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