定植时穴施药剂，控制根部病害防止甜椒死棵。
缓苗后
药剂灌根，巩固防病效果，促进根系发达，避免“头重脚轻”的情况发生。
针对疫霉根腐病发生较严重的棚室，可穴施乙磷铝混加DT各1克进行预防;针对茎腐病发生较严重的棚室，可穴施甲基立枯磷混加DT各1克进行预防。
缓苗后控水，结合划锄2~3次，促进根系生长，防止植株徒长，培育壮棵。直到甜椒结果前一般不进行浇水施肥，但如果植株长势过弱，可适当冲用大源1号生根膨瓜龙或瑞神生物菌肥促根促棵;若长势过旺，还应叶面喷施助壮素进行控制，抑制植株旺长。
利用菌肥以菌抑菌的作用，可穴施或沟施激抗菌968生物菌肥预防根部病害，亩用量80~120公斤即可，同时，菌在不断繁殖过程中还能产生刺激根系生长的物质，促进根系生长、抑制地上部旺长。一药多用，效果显著。
但在使用激抗菌968菌肥时，一定要注意不可与杀菌剂，特别是杀细菌的药剂同时使用。
结果前
控水控肥，促根壮秧，增强植株的连续结果能力和抗病能力。
结果后
甜椒进入结果期后，需水需肥量大增，应及时浇水施肥，促棵促果。针对甜椒需求钾肥量大的特点，可用大源1号美瑞达随水冲施，补充甜椒生长所需的营养，每亩每次用量30~40公斤为宜。在低温季节，可将上述化肥减半配合大源1号新快枪手或激抗菌968冲施肥进行冲施，以达到养根防早衰，促果防低效的生产目的。
另外，针对地下部病害，还要10~15天喷药或熏烟1次，控制病害的发生发展。
