水稻缺钙症状先发生于根及地上幼嫩部分。根系生长很差，茎和根尖的分生组织受损，根尖细胞腐烂、死亡，植株矮小呈未老先衰状。幼叶卷曲且叶尖有粘化现象，叶缘发黄，逐渐枯死。定型的新生叶片前端及叶缘枯黄，老叶仍保持绿色，结实少，秕粒多。
诊断时应注意以下几点：
缺钙与缺硼某些症状相似，如都有生长点、顶芽及根尖枯萎、死亡，嫩芽与新叶扭曲、变形等，容易混淆，须注意辨别。但缺硼叶片及叶柄变厚、变粗、变脆，内部常产生褐色物质，而缺钙无此症状。 植株分析诊断。植株含钙差异颇大，一般双子叶植物如十字花科、豆科等植物含量显著高于单子叶禾本科植物。
南方淋溶的强酸性低盐基土壤易缺钙。一般认为代换性钙小于5～6毫克/100克土时，作物可能缺钙;在钙质土壤中也常发生缺钙，是由土壤盐类浓度过高抑制了对钙的吸收引起。因此，在土壤诊断中要注意盐类浓度的检测，结合植株含钙状况综合分析，作出正确判断。
水稻缺钙的防治：
植物缺钙往往并不是土壤缺钙，而是由于植物体内钙的吸收和运输等生理功能失调而造成的。我国土壤的全钙含量，不同的地区差异很明显。高温多雨湿润地区，不论母质含钙多少，在漫长的风化、成土过程中，钙受淋失后含钙量都很低，如红壤、黄壤的全钙含量在4克/千克以下;而在淋溶作用弱的干旱、半干旱地区，土壤全钙含量通常在10克/千克左右，一般不缺钙。
施用钙肥酸性土壤缺钙，可施用石灰，既提供了钙营养，又中和了土壤酸性。对于中性、碱性土壤，鉴于原因都出于根系吸收受阻，土壤施用无效，应改用叶面喷施，一般用0.3%～0.5%氯化钙液，连喷数次。 由于大量施用氮、钾肥，土壤溶液浓度增高，抑制了作物对钙的吸收，铵态氮肥尤其如此。因此，控制用肥，防止土壤盐类浓度过高，是防治水稻缺钙的基本措施。
高温干旱而土壤溶液浓缩，尤其是在作物需钙较多的时期，如遇干旱极易诱发缺钙，应及时灌溉。
