根据国家苹果产业技术体系病虫防控室、青岛农业大学李保华教授防治意见：苹果褐斑病是典型的雨季病害，连续阴雨是造成苹果褐斑病大流行的前提和条件，这由褐斑病菌的生物学特性所决定。褐斑病菌的分生孢子盘能在高湿条件下(连续阴雨时)连续的产生分生孢子，且产孢的速度很快。初次降雨将孢子冲掉后，不到24小时，分生孢子盘上又会产生出比原来数量更多的孢子。因此，第2天的降雨仍有大量孢子传播侵染。连续阴雨期间，褐斑病菌每天都产生新鲜孢子，甚至到第6、第7天，病斑也没有停止产孢。然而，在雨季，多数杀菌剂的防治效果却难以维持如此长的时间。
部分内吸性杀菌剂，如戊唑醇、氟硅唑等，对褐斑病菌确有好的治疗效果。然而，内吸性杀菌剂只是在病原菌侵染后的5～7天内喷施才有效，病斑一旦显症，再好的药剂也难以控制病斑的扩展和产孢。因此，喷施内吸性杀菌剂需要建立在准确预测预报的基础上。保护性的杀菌剂，如代森锰锌、各种铜制剂等，对褐斑病的侵染也有比较理想的控制效果。然而，多数的保护性杀菌也难以经受连续降雨的冲刷。在第1天的降雨中，这些杀菌剂能起到很好的保护效果，但在第2天的降雨中，其效果就难以保证，而在第3天的降雨中，残留在叶片表面的药剂已基本被雨水冲刷干净，失去其应有的保护效果，但这时病原菌并没有停止产孢、也没有停止侵染。
因此，在连续的阴雨季节，多数的保护性杀菌剂并不能有效保护苹果叶片不受褐斑病菌侵染。在这一点上，波尔多液优于其它保护性杀菌剂。波尔多液的最大优点是耐雨水冲涮，它能在连续多日的降雨中保护叶果不受褐斑病菌和其它病菌的侵染。如烟台苹果产区的雨季常规防病措施。一般年份，烟台果产区有2个连续阴雨期，第一次出现在6月的中下旬，即麦收前后，第二次出现在7月下旬或(和)8月上旬。在这2个阴雨期来临之前，果农都要喷施波尔多液。波尔多液在雨季使用时的配比为：硫酸铜：生石灰：水=1：2～3：200～240(重量)，降雨量越大、持续时间越长，石灰的用量应越大，以保证药剂的粘着性。在喷施波尔多液的间隔期，喷施内吸性杀菌剂，以控制已侵染的病菌。4-5月份或苹果套袋前禁用波尔多液，以防产生药害。
要想在雨季有效控制苹果褐斑病的危害，一方面需要加强前期病害的管理，根据药剂的特效期连续用药，不给病菌侵染的机会;另一方面，在雨季到来之前，喷施波尔多液等保护性杀菌剂，能有效控制连续阴雨期间病原菌的大量侵染，避免发病。
