南瓜果腐病，又叫花腐病，发病时满身长黑毛，一般是最上面刚坐住的那个。病斑首先是从萎蔫的花朵处开始出现，而后从瓜蒂浸入并逐渐蔓延到幼果上，被害的果实从顶部向下腐烂，在病斑上长出浓密的黑色大头针状病菌孢子，使果实迅速腐烂。其病原菌是瓜笄霉，是接合菌亚门的一类真菌，适乐时对真菌中的子囊菌、半知菌、担子菌亚门的病原菌有较好的防效，因此点花药中加的适乐时对南瓜果腐病的防效有限，不能够阻止其发病。
小南瓜果腐病防治方法：开花至幼果期喷洒78%波·锰锌(科博)600倍液或86.2%氧化亚铜(铜大师)1000倍液、47%春·王铜(加瑞农)700倍液预防。发病初期喷洒72%锰锌·霜脲(克露)600倍液或69%锰锌·烯酰(安克锰锌)700倍液、60%氟吗·锰锌(灭克)700-800倍液。当前随着温度的降低要特别注意控制棚室湿度，避免出现低温高湿的情况，阴天如需用药，提倡用百菌清烟剂，每亩250g。
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