(一)病虫虫类
芦笋常见病害有猝倒病、茎枯病、碳疽病;虫害主要有甜菜夜蛾、甘蓝夜蛾、棉铃虫、玉米螟、蚜虫、飞虱以及地老虎、蛴螬等地下害虫。
(二)防治方法
在生产过程中应从作物一病虫草等整个生态系统出发，综合运用各种防治措施，创造不利于病虫草害孳生和有利于各类天敌繁衍的环境条件，保持农业生态系统的平衡和生物多样化，减少各类病虫草害所造成的损失。
1、优先采用农业措施。通过选用抗病虫品种，非化学药剂种子处理，培育壮苗，加强栽培管理，中耕除草，秋季深翻晒土，清洁田园，轮作换间作套种等一系列措施起到防治病虫草害的作用。同时还应尽量利用机械捕捉害虫，机械和人工除草等措施，防除病虫草害。
2、物理措施。田间挂银灰色反光膜避蚜防病毒，罩30目防虫网防止各种虫害，安装黑光灯、高压汞灯、频振式杀虫灯诱杀害虫成虫，田间插设杨树枝把、谷草把诱集粘虫，设黄板诱杀蚜虫、温室白粉虱、美洲斑潜蝇等。
3、特殊情况下，必须使用农药时，应遵守以下准则：
必须是有机食品生产允许使用的资料农药类产品，在有机食品生产资料农药类不能满足植保工作需要的情况下，可试用以下农药：(1)中等毒性以下植物源杀虫剂、杀菌剂、拒避剂和增效剂。如除虫菊素、鱼藤酮、烟草水、大蒜素、苦楝、川楝、印楝、芝麻素等。(2)释放寄生性捕食性天敌动物，昆虫、捕食螨、蜘蛛及昆虫病原线虫等。(3)在害虫捕捉其中食用昆虫信息素及植物源引诱剂。(4)可以使用矿物油和植物油制剂以及矿物元农药中的硫制剂、铜制剂。(5)经专门机构核准，允许有限度地使用活体微生物农药，如真菌制剂、细菌性制剂、病毒制剂、放线菌、拮抗菌剂、昆虫病原线虫、原虫等。
禁止使用有机合成的化学杀虫剂、杀螨剂、杀菌剂、杀线虫剂、杀线虫剂、除草剂和植物生长调节剂，以及一些基因工程品种(产品)及制剂。
