1.合理轮作
重茬是造成大葱根腐病的关键因素。由于连续多年种植，土壤中病原菌增多，极易造成大葱因感染重茬病害根腐死棵。所以，在种植大葱的地块与其他作物轮作很重要，但注意不要与大蒜、韭菜轮作。
2.控制土壤湿度
种植大葱过程中，若培土时土壤湿度过大，会影响大葱根部的正常呼吸，使大葱自身抗性下降，加剧病害发生。所以在多雨季节，要注意做好大田排水，避免积水沤根，诱发大葱根腐病。
3.冲施生物菌肥
对于大葱根腐病的防治，做好前期的预防很关键。在大葱培土前，可随水冲施生物菌肥，增加土壤有益菌，抑制病原菌浸染。
4.喷施药剂
因为根腐病属细菌性病害，具有传染性。所以，在发生了根腐病的地块喷施药剂，对未发病的种植区域做好防范很关键。张树学建议农户，喷施的药剂可选用甲基托布津和硫酸链霉素。
