辣椒细菌性病害较多，主要有辣椒疮痂病、辣椒软腐病、辣椒叶斑病、辣椒青枯病等。
发病症状：(1)辣椒疮痂病，成株期在叶片背面出现水浸状黄绿色斑点隆起，表面粗糙，呈疮痂状。果实被害出现暗绿色隆起的小斑点，呈疱疹状，稍隆起。(2)辣椒软腐病，主要是危害果实，病果出现水浸状暗绿色斑，后变褐软腐，有臭味，内部果肉腐烂，果皮变白。(3)辣椒叶斑病，主要危害叶片，成株叶片发病，初为水浸状黄绿色小斑点，后扩大渐变为褐色或铁锈色病斑，膜质，大小不等。(4)辣椒青枯病，主要危害根部，地上部枝叶表现萎焉，后期叶片干枯，整株死亡;地下部外表不明显，剖见维管束变为褐色。
发病条件：以上症状均为细菌所致。病菌随病残体在土壤中存活，通过流水传播，由伤口浸入。高温、高湿发病重，阴雨天或浇水后发病重。
防治方法：(1)清除病残体，避免重茬连作，起隆栽培，合理密植，切记大水漫灌，加强通风散湿。(2)药剂防治：辣椒疮痂病、软腐病、叶斑病可用农用链霉素或新植霉素4000倍液，77%可杀得500倍液，78%科博500倍液，每5-7天喷一次，连喷2-3次。辣椒青枯病发生在根部，可用以上药剂进行灌根，每株灌药液0.5公斤，每10-15天灌一次，连灌2次。
