一、生理性病害
1、缺钙西红柿光呼吸作用产生各种有机酸，其中草酸能引起中毒而发病。在西红柿植株体内钙充分时，草酸被钙中和，形成草酸钙，可避免草酸损害，缺钙时则易发生脐腐病，造成烂果。
2、水分供给失调进入大批结果期，温度高，因为叶片蒸腾量大，使本应输到果实的水分被叶夺取，叶细胞的浸透压高于绿果细胞的浸透压，叶甚至从果实内夺取水分，表现大批失水景象，组织坏死，造成烂果。
3、防治办法(1)改良泥土：选择土层深厚、保水力强的沙壤土栽种西红柿，对泥土过粘或含沙过多的，应多施有机肥改良其通透性，加强其保水保肥能力。(2)平衡施肥：避免施用未腐熟的有机肥或无机肥料浓渡过高，避免烧伤根系。基肥以腐熟有机肥为主，联结整地每亩施过磷酸钙50公斤，石灰50公斤。有机肥量每亩施30005000公斤。避免使用单质肥料，追肥时应留意氮、磷、钾肥的配合使用，氮、磷、钾复合肥每亩底施1520公斤。(3)加强水分管理。必须保证西红柿植株水分的均衡供给。
二、病虫害
1、真菌侵染主要有(1)灰葡萄孢菌，该病菌以菌核、菌丝体或分生孢子在病残体上、泥土中或地表越冬越夏导致灰霉病，花期是灰霉病侵染顶峰期，温室湿度大是诱发灰霉病的最主要起因，该病菌从伤口、苍老的器官和花器侵入，造成烂果。(2)霉菌，导致晚疫病，在果实上长出灰绿色水浸状硬板块，边缘不明显，后变深褐色，湿度大时病部长出少量白霉。病菌随风、水、雨水飞溅传播，田间病果、植株清理不彻底，穿插感染健康植株。(3)拟茎点霉菌，引起褐纹病，果实被害时，开端产生浅褐色椭圆形稍凹陷病斑，后变黑褐色，造成果实糜烂，高温多湿，扩展迅速。
防治办法(1)综合防治。进行无病土培养壮苗，合理密植，加强通风透光，尤其是阴天应严格节制灌水。及时清理病残体，摘除病果病叶，带出田外，集中销毁和深埋。在整枝打叉时，用消毒液洗手，把中心病株拔除，并用生石灰撒穴消毒。(2)药剂防治。喷雾可选用50%速克灵可湿性粉剂、60%的霉克多可湿性粉剂和60%的杀毒矾800倍液混杂使用;50%利霉康可湿性粉剂、50%的疫快净、60%的甲霜灵锰锌可湿性粉剂800倍液混杂使用。
2、病毒侵染病毒病是发生最普遍、损害较重、最难防治的病害。在秋季发病较重，主要症状是卷叶，落蕾落花，果实呈花脸或烂掉。病毒多靠蚜虫传播，在高温干旱时发病较重。
防治办法(1)综合防治。选用抗病耐病品种;播种时进行浸种消毒;履行23年轮作，干净田园，及时防治蚜虫。(2)药剂防治。可用20%的病毒A可湿性粉剂500倍，或1.5%植病灵乳剂500倍液，或高锰酸钾1000倍液喷雾，57天一次，连喷24次。
3、害虫损害棉铃虫以幼虫蛀食果实，一年发生34代，各代都可损害西红柿，高温多湿条件下有利于发生。
防治办法主要用黑光灯诱杀成虫，幼虫可在其刚孵化二龄前，尚未蛀入果实内时喷药杀虫。常用药剂有20%杀灭菌酯乳油20003000倍，或50%辛硫磷乳油10001500倍液。
