1.防寒保苗,秋播越冬的时间长，而幼苗在气温5℃以下容易受冻害，因而要保苗防寒。早春可用护树大将军母液的1000倍液(500公斤)喷涂幼苗保温,消毒防霜冻,阻碍越冬病毒着落于树体繁衍,恢复果树生命指挥系统早苏醒,亦可与各类农药混配。苗床要用薄膜覆盖防寒，但要注意控制膜内温度最高不能超过35℃，最低不能低于5℃。阴雨天、阴冷天不宜揭膜。在有阳光、温度高的中午，薄膜栅不能密封，也不可以全部揭开，以防温度过高灼烧死苗。
2.水肥管理,木瓜苗组织幼嫩，根群吸收能力较弱，对水肥过多或过少都十分敏感。若遇到干旱天气，要早晚淋水。当幼苗长出2～3片真叶后，应逐渐减少淋水量，防止过湿引起烂根。4～5片真叶后，以淋腐熟粪水为主，浓度要由淡到浓。
3.防治病虫,木瓜苗抗病力弱，常见病害有折腰病、炭疽病等，根据农资淘宝指南介绍可喷施800倍液新高脂膜加1000倍液配合针对性杀菌剂防治。虫害主要有红蜘蛛，可用800倍液新高脂膜配合杀虫剂防治，发现花叶病要立即拔除病株。
