天麻软腐烂窝是是一种常见生理性病害，发生软腐的天麻块茎萎黄，中心组织腐烂，切面会渗出有异臭的白色浆水浓液。其发生原因主要是生长环境不良。
①土质选择不当。软腐烂窝多见于土壤保墒、透气性能差的硬碴地和死黄泥地，蜜环菌在这种场地生长发育不良，天麻由于得不到蜜环菌营养而蔫腐死亡。
②高温、高湿环境。在这种气候条件下，有利于杂菌生长，蜜环菌材上很快出现灰白色的杂菌菌丝，并逐渐向窝内腐殖蔓延，菌丝间形成黄白色、菜籽状的菌核。天麻经病害菌浸染，即从局部腐烂漫延。
③多雨、排水不良。在积水的条件下，天麻生育受抑，溶菌功能显著减弱。但蜜环菌由于抗逆能力较强，仍能正常生长，蜜环菌突破天麻的溶层在块茎内迅速繁殖“反蚀”。其特征是腐烂的块茎皮下，充满着蜜环菌菌索，烂窝内的菌材上的蜜环菌菌索密集。这种烂窝现象多发生在雨季。
④栽培天麻技术失误。这种情况多见于菌材不足、下种量过大、穴内无足够的腐殖质填充物等原因造成，由于得不到蜜环菌充分的营养供给，从而天麻生长缓慢、瘦弱，进而逐渐导致软腐。
