在水产养殖中，饲料费用占养殖成本的60%以上，降低饲料成本是增加养鱼效益的关键。应用复合EM菌，把农作物秸杆(如麦秆、稻草、玉米秆、花生壳等)生产成为鱼生物饲料，不但养殖效益显著提高，而且饲料成本还大幅降低。
复合EM菌能产生多种促长因子、促免疫因子、辅酶Q等，促进幼体生长发育，在水产养殖上有如下作用：
1、减少水体中有毒、有害物质的含量，消除死鱼现象;
2、增加水体含氧量，减少或消除鱼的浮头现象;
3、减少开增氧机时间，减少换水，节电省工，生产成本显著降低;
4、特别显著地提高幼鱼苗和成虾的成活率;
5、消除鱼虾因细菌引起的皮肤病，使鱼虾外观健壮;
6、显著增加鱼的食量，迅速增重，进而提高产量。
利用农作物秸秆生产鱼生物饲料，其营养成分比玉米还要高，综合营养好，并且由于体积大，比重小，在水中的悬浮时间长达1小时左右，是鱼虾较理想的饲料。
应用复合EM菌，利用农作物秸秆生产高效鱼生物饲料的具体方法如下：
1、将作物秸秆粉碎;
2、把秸秆粉放进发酵池内，加入秸秆粉重量80%的水、1%的糖化酶、1%的复合酶、0.5%的活酵母和1%的氯化钠以及0.5%的乳酸，充分搅拌均匀;
3、接入3%的复合EM菌，在15℃—35℃温度下培养2天时间，料层长满白色菌丝发出香味即得高效鱼生物饲料，可制成颗粒烘干贮存。
高效鱼生物饲料含有较丰富的氨基酸和微量元素，富含丰富的B族维生素、叶酸、辅酶Q等抗病毒物质和生物活性物质以及各种免疫促长因子。鱼虾食后能增强抗病能力，促进生长。其营养成分经检测表明：含粗蛋白12.31%，粗脂肪4.20%，粗纤维19.24%，其中三种主要氨基酸的含量为：赖氨酸0.68%，蛋氨酸0.16%，胱氨酸0.19%。
使用高效鱼生物饲料喂养鱼虾具有成活率高、病害少、换水少、产量高、成本低等优点。具体效果如下：
1、鱼虾的受精卵孵化率可提高20%左右;
2、防治鱼虾病，可提高成活率20%—40%;
3、鱼虾的外观健壮，肉质特好，并可提高产量20%—30%;
4、可减少开增氧机时间三分之二，降低生产费用;
5、把农作物秸秆变弃为宝，饲料成本降低60%左右。
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