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现代畜禽养殖业所面临的最大威胁是畜禽的疫病。面对复杂的疫情和高昂的药价，消毒是最简单、最低成本控制疫情的方法。进行科学有效的消毒是减少疫病发生的最重要措施之一。下面就如何科学消毒介绍如下：
(一)消毒方法的种类
1.卫生消毒法。通过清扫、水冲、洗刷、粉刷等手段，直接减少病原体的方法。
2.物翌消毒法。利用阳光、紫外线、火焰及高温等手段杀灭病原体的方法。
3.化学消毒法。利用各种化学消毒药剂杀灭病原体的方法，主要方法有浸泡、喷洒、熏蒸等。
4.生物消毒法。利用微生物发酵的方法杀灭病原体，主要针对粪便和垫料。
(二)主要的消毒对象
消毒的主要对象是动物分泌物、排泄物以及被污染的场地，包括圈舍、周边环境、垫料、用具、饲养人员的衣物、鞋靴、生活环境、进出车辆等。
(三)一般的消毒程序
要想达到满意的消毒效果，就一定要按科学的程序进行。畜禽栏舍的空栏消毒要按以下程序：清扫--清洗一干燥一消毒--清洗一再消毒一再清洗一干燥，而且消毒过程中的顺序也有讲究，即从高到底、从一侧到另一侧。
(四)养殖场的常用消毒剂
消毒药品种繁多，按其性质可分为醇类、碘类、酸类、碱类、卤素类、酚类、氧化剂类、挥发性烷化剂类等，下面主要介绍畜禽饲养场常用的几种消毒药：
1.氢氧化钠(又称苛性钠、烧碱或火碱)。碱类消毒剂，粗制品为白色不透明固体，有块、片、粒、棒等形状，成溶液状态的俗称液碱。主要用于场地、栏舍等消毒。2%～4%溶液可杀死病毒和繁殖型细菌，30%溶液10分钟可杀死芽孢，4%溶液45分钟杀死芽孢，如加入10%食盐能增强杀芽孢能力。实践中常以2%的溶液用于消毒，消毒1～2小时后，用清水冲洗干净。
2.石灰(生石灰)。碱类消毒剂，主要成分是Ca0，加水即成氢氧化钙，俗名熟石灰或消石灰，具有强碱性，但水溶性小，解离出来的氢氧根离子不多，消毒作用不强。1%石灰水杀死一般的繁殖型细菌要数小时，3%石灰水杀死沙门氏菌要1小时，对芽孢和结核菌无效。其最大的特点是价廉易得。实践中，20份石灰加水到100份制成石灰乳，用于涂刷墙体、栏舍、地面等，或直接加石灰于被消毒的液体中，或撒在阴湿地面、粪池周围及污水沟等处消毒。
3.赛可新(Selko-pH)。酸类消毒剂，主要成分是复合有机酸，用于饮水消毒，用量为每升饮水添加1.0—3.0毫升。
4.农福。酸类消毒剂，由有机酸、表面活性剂和高分子杀微生物剂混合而成。对病毒、细菌、真菌、支原体等都有杀灭作用。常规喷雾消毒作l：200稀释，每平方米使用稀释液300毫升，多孔表面或有疫情时，作1：100稀释，每平方米使用稀释液300毫升;消毒池作1：100稀释，至少每周更换1次。
5.醋酸。酸类消毒剂，用于空气熏蒸消毒，按每立方米空间3～10毫升，加1～2倍水稀释，加热蒸发。可带畜、禽消毒，用时需密闭门和窗。市售酸醋可直接加热熏蒸。
6.漂白粉。卤素类消毒剂，灰白色粉末状，有氯臭，难溶于水，易吸潮分解，宜密闭、干燥处储存。杀菌作用快而强，价廉而有效，广泛应用于栏舍、地面、粪池、泄物、车辆、饮水等消毒。饮水消毒可在1 000千克河水或井水中加6～10克漂白粉，10～30分钟后即可饮用;地面和路面可撒干粉再洒水;粪便和污水可按1：5的用量，一边搅拌，一边加入漂白粉。
7.二氧化氯消毒剂。卤素类消毒剂，是国际上公认的新一代广谱强力消毒剂，被世界卫生组织列为Al级高效安全消毒剂，杀菌能力是氯气的3～5倍，可应用于畜禽活体、饮水、鲜活饲料消毒保鲜、栏舍空气、地面、设施等环境消毒、除臭;本品使用安全、方便，消毒除臭作用强，单位面积使用价格低。
8.消毒威(二氟异氰尿酸钠)。卤素类消毒剂，使用方便，主要用于养殖场地喷洒消毒和浸泡消毒，也可用于饮水消毒，消毒力较强，可带畜、禽消毒。使用时按说明书标明的消毒对象和稀释比例配制。
9.二氟异氰尿酸钠烟熏剂。卤素类消毒剂，本品用于养蚕消毒及畜禽栏舍、饲养用具的消毒;使用时。按每立方米空间2—3克计算，置于畜禽栏舍、蚕室中，关闭门窗，点燃后即离开，密闭24小时后，通风换气即可;还可用于蘑菇房、蔬菜大棚消毒。
10.氯毒杀。卤素类消毒剂，使用同消毒威。
11.百毒杀。双链季铵盐广谱杀菌消毒剂，无色、无味、无刺激性和腐蚀性，可带畜、禽消毒。配制成万分之三或相应浓度用于畜禽圈舍、环境、用具、种蛋、孵化室的消毒，万分之一的浓度用于饮水消毒。
12.东立铵碘。双链季铵盐、碘复合型消毒剂，对病毒、细菌、霉菌等病原体都有杀灭作用。可供饮水、环境、器械、畜禽和种蛋等消毒;饮水、喷雾、浸泡作1：2000～2500稀释，发病时作1：1 000一1250稀释。
13.菌毒灭。复合双链季铵盐灭菌消毒剂，具有广谱、高效、无毒等特点，对病毒、细菌、霉菌及支原体等病原体都有杀灭作用;饮水作1：1500—2000稀释1日常对环境、栏舍、器械消毒(喷雾、冲洗、浸泡)作1：500～1000稀释;发病时作300倍稀释。
14.福尔马林。醛类消毒剂，是含37%～40%的甲醛水溶液，有广谱杀菌作用，对细菌、真菌、病毒和芽孢等均有效，在有机物存在的情况下也是一种良好的消毒剂，缺点是有刺激性气味。以2%一5%水溶液用于喷洒墙壁、地面、料槽及用具消毒;房舍熏蒸按每立方米空间用福尔马林30毫升，置于一个较大容器内(至少10倍于药品体积)，加高锰酸钾15克，事前关好所有门窗，密闭熏蒸12～24小时，再打开门窗去味。熏蒸时室温最好不底于15℃，相对湿度在70%左右。
15.过氧乙酸。氧化剂类消毒剂，纯品为无色透明液体，易溶于水，是强氧化剂，有广谱杀菌作用，作用快而强，能杀死细菌、霉菌芽孢及病毒，不稳定，宜现配现用。0.1%～0.2%溶液用于耐腐蚀小件物品的浸泡消毒，时间2～120分钟;0.1%～0.5%或以上喷雾，喷雾时消毒人员应戴防护目镜、手套和口罩，喷后密闭门窗1～2小时;用3%-5%溶液加热熏蒸，每立方米空间2～5毫升，熏蒸后密闭门窗l～2小时。
(五)影晌消毒效果的因素
1.消毒药的选择。一般病毒对碱、甲醛较敏感，而对酚类抵抗力强，大多数消毒药对细菌有很好的杀灭作用，但对形成芽孢的杆菌和病毒作用却很小，而且病原体对不同的消毒药的敏感性不同，因此，在选用消毒药时应针对消毒对象，有的放矢，正确选择。
2.消毒药浓度。使用消毒药前应仔细阅读说明书，根据不同对象和目的，按其消毒效果最佳的浓度配制，一般情况下，浓度越大，消毒效果越好。
3.消毒时间。不同病原体对不同消毒药物敏感程度不一样，对杀灭病原体所需时间也不同，一般消毒时间越长，消毒效果越好。如药物喷洒后，一般要求至少保持20分钟以上才可冲洗。
4.温度和湿度。消毒效果与温度正相关，温度越高，效果越好。熏蒸等消毒方式对湿度也有要求，一般要求相对湿度保持在65%～75%。
(六)使用消毒药的注意事项
1.消毒药要求保存在阴凉、干燥、避光的环境下，否则会造成消毒药的吸潮、分解、失效。
2.购买和使用消毒药要注意外包装上的生产日期和保质期，必须在有效期内使用。
3.实际使用时，尽量不要把不同种类的消毒药混在一起使用，防止2种成分发生拮抗反应，削弱甚至失去消毒作用。
4.消毒池内的消毒药应定期调换，以确保有效的消毒效果。
5.免疫前后1天和当天(共3天)不喷洒消毒药，前后2—3天和当天(共5～7天)不得饮用含消毒药的水，否则，会影响免疫的效果。
6.一般的消毒剂用水稀释后稳定性会变差，所以要现用现配，不宜久放。
7.定期轮换使用、恰当、配伍使用。由于不同类型的微生物对消毒剂的抵抗力不同，某种致病菌可能不能被杀灭而大量繁殖，对消毒剂也可能产生抗药性，而且长期使用同种消毒剂，也容易使细菌、病毒产生耐药性，从而降低了应有的消毒效果。
