现在猪场所饲养的二元猪三元猪，这些优秀的商品猪就是猪遗传育种的结晶，猪遗传育种是根据生产情况和市场需要，培育出符合要求的育种目标，可以做到降低生产成本和增加猪肉品质等目标，而为了达到则个目标需要对猪系统的选育长期的选择，这就是猪的遗传育种技术。
一、育种原理
(一)育种目标的确定 育种目标(breeding objective )从广义上讲是使养猪生产获得最大的经济效益。可见育种目标强调了三点：①育种的最终目标在生产群实现;②目标的制定是以未来可预见的生产条件和市场需求为基础;③目标的着眼点是经济效益的最大值。因此，原则上凡是对养猪生产有经济意义的生产性状或与生产性状有关的次级性状(Secondary trait)都应包括在育种目标中。另外，育种目标应该立足于长远的考虑，并且在育种方案的实施过程中，要随着生产条件和市场需求的变化，不断修订育种目标。
由于将育种目标确定在经济效益基础之上，因此， 要用经济评估的方法确定数量化的育种目标，即用综合育种值(total breedingva1ue)来表达数量化的育种目标。综合育种值是一个线性函数，它应包含对养猪生产获利性起作用的生产性状与次级性状，并根据各性状的经济重要性分别给予加权。
AT =∑AiWi 式中AT为综合育种值，Ai为性状i的育种值，Wi为性状i的经济加权系数，即经济重要对于数量化的育种目标需考虑两个问题，一是选择作为育种目标的生产性状(目标性状);二是确定目标性状的经济加权值。
目前在瘦肉型猪的育种中，父系猪种一般只考虑生产生状(日增重、饲料转化率、瘦肉率等)以及肉质性状(肌内脂肪含量、肉质指数等)，而不把繁殖性状包括在内;对于母系猪种繁殖性状(总产仔数)和上述生产性状包括在育种目标中，但不含肉质性状。
猪群育种
计算目标性状的经济加权系数的方法有：差额法、生产函数法、回归法、单个场的最优化法和区域平衡最优化法等。其中差额法简单实用，经济加权系数(这里可以理解为边际效益)等于边际产出减边际投入。
(二)充分利用加性和非加性遗传效应 获得遗传进展的两个基本途径，一是利用纯种群内的遗传变异，二是利用不同种群间的遗传变异。
1.利用加性遗传效应 即选择。基因的加性效应值就是性状的育种值，
在基因的传递过程中，加性效应是相对稳定的。种猪遗传改良的中心任务，就是通过选择来提高性状的育种值，获得遗传进展。
选择获得遗传进展有三个基本条件：①性状有变异，即群内个体间的性状值差异。对遗传力相同或相近的性状来说，群内变异越大，获得的选择反应也越大。②变异是可以遗传的，如果性状表型值的变异仅仅是由环境因素造成，而与遗传因素无关，那么选择也不会产生作用。反之，表型变异中加性遗传效应所占比例越大，即遗传力越高，则选择反应也就越大。同时，选择效果在很大程度上取决于利用表型值估计育种值的准确性，这里选择方法在育种中起关键作用。③变异是可以度量的，选择必须建立在准确度量性状值的基础上。对于一些确有遗传变异但无法直接度量或度量后造成个体死亡的性状(如胴体性状)，是不能进行直接选择的，但可以通过一些相关性状作间接选择。
总之，选择以消耗群内的加性遗传方差为代价，使群体的育种值及表型值得以提高。在闭锁群内长期选择，将会使群内加性方差逐渐减少，遗传改良速度减慢。如果能适时引入一些外源基因，就能在不影响群体均值的前提下，增大群内加性方差，为选择提供素材。猪的育种实践证明，通过选择来充分利用性状的加性效应，是瘦肉型猪种主要生产性能持续改良的主要手段。
2.利用非加性遗传效应 即杂交。在构成表型值的效应中，除了加性效应外， 还有非加性效应——显性(包括超显性)效应和上位效应。显性效应是相同座位不同等位基因间的效应，上位效应是不同座位基因间的互作效应。
显性效应对产仔数这一低遗传力性状具有重要影响，而对于高遗传力性状(如胴体组成性状)影响甚微。研究表明，显性效应是构成杂种优势的主要因素。上位效应也与杂种优势的大小有密切关系，但其稳定性和可预测性要比显性效应差。繁殖性状的非加性效应显著，可以获得明显的杂种优势。因此，通过杂交生产商品猪已成为现代育种的基本方法。
猪的育种工作应当一方面提高纯种的生产性能(加性效应)，另一方面同时最大限度地利用杂种优势，即非加性效应。提高非加性效应的方法有两个：①配合力测定，常见方法，即在纯种选择的基础上，通过配合力测定来筛选生产性能最好的杂交配套组合，育种及生产实践证实，在现代瘦肉型猪种中，长大(长白猪♂*大白猪♀) 以及杜长大(杜洛克♂*长大♀)是最佳的杂交配套组合。
②通过正反交重复选择(MRRS)，在纯种内同时提高纯种的育种值和杂种传势。该方法将在以后章节详细介绍。
(三)平衡育种 猪的生产性状众多，性状间存在着不同的表型和遗传相关，
当通过选择使某一性状发生变化时，其它一些性状可能发生相关反应，其变化量的大小取决于性状的遗传力和性状间的遗传相关等。
在育种实践中，必须考虑到性状间的相关，保持性状间的合理平衡，即平衡育种，一方面要注意性状间遗传颉抗作用(负遗传相关)，如选择瘦肉率， 该性状改良到一定程度，肉质下降;另一方面克服自然选择的干扰，如生长速度快、瘦肉率高的猪种，产仔数少、体躯长而高的猪种，体质变弱，以及个别猪种出现遗传缺陷—— 猪应激综合征，都可以认为是自然选择的结果。因此，我们需要努力实现这样一个性状的合理平衡，即增重快、瘦肉多和肉质好的目标。
