杀菌剂对微生物作用的中毒表象主要表现为影响菌丝的生长、孢子萌发、细胞的透过性、有丝分裂、呼吸作用及细胞膨胀，细胞原生体的解体和细胞壁受损坏等。实质上是微生物细胞相关的生 理、生化反应和代谢活动受到了干扰和破坏，最终 导致微生物的生长繁殖被抑制，甚至死亡。
杀菌剂对微生物的作用，有的是真正把菌杀死，有的只是由于微生物生命活动的某一过程受阻而受到抑制，所以有杀菌作用和抑菌作用之分。不过，杀菌和抑菌是相对而言的，它与杀菌剂的性质、使用浓度及作用时间的长短有着密切的关系。
杀菌剂作用机制分为：破坏菌体结构；影响 代谢作用和生理活动
