草甘膦属低毒除草剂，水溶性差，难以直接使用，因开发初期技术有限，没能做得出可令草甘膦可直接溶解于水的农药产品，当时要将草甘膦加工配制成异丙胺盐、钾盐或钠盐等草甘膦盐类才能溶解于水使用，才能做出在农业、林业上可以使用的除草剂产品。在1997年，南通飞天化学实业有限公司开发制成草甘膦直接溶解于水的产品，成功发明了“混和直溶法”，利用该公司独立开发的植物源助剂（SD、SDP）与草甘膦原药物理混合成粉剂、粒剂，即可溶于水使用。
玉米、大豆保护性耕作中未被完全利用的除草剂会流失到地表水中，并且在水中含量往往超过美国污染物最高 限量和各类生态标准的规定，因此推荐使用种植耐草甘膦作物，并用半衰期更短、土壤吸收能力更强的草甘膦型除草剂替代常规型产品（alachlor、 atrazine、linuron、metribuzin）。为了比较不同除草剂的流失情况，美国农业部科学家Martin Shipitalo和Lloyd Owens在两块经过翻耕的田地和两块未耕田地分别施用草甘膦除草剂和其它会残留的除草剂，随后监测3年中除草剂的流失情况。这几块地每隔2年就会进行玉 米和大豆轮作。
总之，无论是否进行翻耕处理，草甘膦型除草剂的流失量都要比atrazine、alachlor和linuron少。因此，配合耐性作物使用草甘膦除草剂可以有效的减少作物生产对地表水质量的影响。
