首先禁止从病区引种，其次实行轮作倒茬，稻麦轮作或与棉花、烟草、蔬菜等经济作物轮作，也可改种大豆、油菜、马铃薯等，轮作倒茬以切断全蚀病菌源积累，可明显降低发病。合理施肥。底肥增施有机肥、生物肥，提高土壤有机质的含量。化肥施用应注意氮、磷、钾的配比。
在药物上的防治小麦立枯病需要如何做呢？提倡用种子重量0.2%的2%立克秀拌种，防效90%左右。严重地块用3%苯醚甲环唑悬浮种衣剂（华丹）80毫升，兑水100-150ml，拌20-25斤麦种，晾干后即可播种也可贮藏再播种。小麦播种后20—30天，每6672使用15%三唑酮(粉锈宁)可湿性粉剂150—200g对水60L，顺垄喷洒，翌年返青期再喷一次，可有效控制全蚀病为害，并可兼治白粉病和锈病。在上麦全蚀病、根腐病、纹枯病、黑穗病与地下害虫混合发生的地区或田块，可选用40%甲基异柳磷乳油50ml或50%辛硫磷乳油100ml，加20%三唑酮(粉锈宁)乳油50ml后，对水2—3kg，拌麦种50kg，拌后堆闷2—3小时，然后中。可有效防治上述病害，兼治地下害虫。小麦白粉病、根腐病、地下害虫及田鼠混合发生的地区或田块，用75%的3911乳油150ml，加20%三唑酮(粉锈宁)乳油20ml，对水2—3kg，拌麦种50kg，可有效地防治根腐病、白粉病，兼治地下害虫。(6)提倡施用多得稀土纯营养剂，每6672用50g，对水20—30L于生长期或孕穗期开始喷洒，隔10—15天一次，连续喷2—3次。
