苹果根癌病主要在根颈部位发生，侧根和支根上也能发生，发病初期在被侵染处发生黄白色小瘤，瘤体逐渐增大，并逐渐变黄褐色至暗褐色。瘤的内部组织木质化，表皮粗糙，近圆形或不定形，一般在两年生苗上，可长出直径5～6厘米的瘤，小的如核桃，大树根瘤直径可达10～15厘米，病树根系发育不良，地上部生长受阻，所以多数病株衰弱，但一般不死亡。
发病规律：根癌病菌在自然条件下能长期存在于土壤中，因此土壤带菌是病害的主要侵染来源。病菌由伤口侵入，从侵入到表现明显症状，一般约需2～3个月。病菌从伤口侵入，不断刺激寄主细胞增生膨大，以致形成癌瘤，土壤结构和酸碱度对发病有一定影响，一般偏碱性的疏松土壤有利于发病，酸性土壤不利于发病。
防治方法：
（1）改良土壤，选择育苗地，土壤性质对此病影响很大，应选择弱酸性土壤育苗或采用技术措施，使苹果园土壤变为弱酸性。选用无菌地育苗，苗木出圃时，要严格检查，发现病苗应立即淘汰。建立无病果园。
（2）苹果苗嫁接时，应尽可能采用芽接法，芽接法比劈接法嫁接的苗木发病少。砧木苗用抗根癌菌剂浸根后定植，可控制病菌侵染。
（3）加强树体和根部保护，加强地下害虫防治，减少各种伤口，以减少被侵染的机会，减少发病。
（4）刨除病根，在伤口外涂药保护。如发现大树有根病，应该刨走病根和病瘤，伤口处涂抗菌剂402、100倍福美胂液、波尔多液保护或晾根换土。
